126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0345 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  50.98 
 
 		 819 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  49.09 
 
 		 825 aa  684    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  80.98 
 
 		 820 aa  1233    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  52.21 
 
 		 815 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  68.09 
 
 		 821 aa  965    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  68.33 
 
 		 821 aa  991    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  67.84 
 
 		 821 aa  981    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  100 
 
 		 819 aa  1612    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  64.88 
 
 		 820 aa  951    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  50.92 
 
 		 819 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  65.53 
 
 		 821 aa  984    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  53.93 
 
 		 795 aa  634  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  50.55 
 
 		 820 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  50.91 
 
 		 826 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  46.94 
 
 		 800 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  51.47 
 
 		 819 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  51.54 
 
 		 800 aa  624  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  49.63 
 
 		 802 aa  611  1e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  52.83 
 
 		 795 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  52.7 
 
 		 795 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  46.82 
 
 		 793 aa  545  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  42.02 
 
 		 804 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.99 
 
 		 817 aa  325  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  29.4 
 
 		 817 aa  323  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  29.94 
 
 		 817 aa  307  6e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  30.51 
 
 		 836 aa  300  6e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  30.21 
 
 		 836 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  29.99 
 
 		 836 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  28.2 
 
 		 865 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  29.2 
 
 		 887 aa  264  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  28.31 
 
 		 889 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  29 
 
 		 889 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  28.8 
 
 		 887 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  28.87 
 
 		 889 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  27.64 
 
 		 884 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  28.1 
 
 		 879 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  28.14 
 
 		 840 aa  258  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.4 
 
 		 897 aa  251  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 		 839 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  27.78 
 
 		 878 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 		 847 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  28.93 
 
 		 845 aa  230  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  27.27 
 
 		 849 aa  229  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  28.2 
 
 		 847 aa  224  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  29.17 
 
 		 850 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  26.42 
 
 		 855 aa  219  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  27.07 
 
 		 849 aa  219  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 		 845 aa  207  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  25.6 
 
 		 803 aa  207  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 837 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.24 
 
 		 850 aa  205  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.07 
 
 		 870 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.39 
 
 		 866 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  29.15 
 
 		 843 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  29.5 
 
 		 753 aa  159  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  23.73 
 
 		 813 aa  156  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  32.29 
 
 		 843 aa  132  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.39 
 
 		 858 aa  128  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  25.71 
 
 		 858 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  28.86 
 
 		 872 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  24.54 
 
 		 929 aa  120  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  34.08 
 
 		 841 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  30.57 
 
 		 846 aa  115  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.87 
 
 		 851 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  25.7 
 
 		 846 aa  111  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  22.2 
 
 		 855 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 849 aa  107  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 857 aa  104  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.49 
 
 		 850 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  25.54 
 
 		 853 aa  94.4  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  23.9 
 
 		 844 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  25.49 
 
 		 855 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  32.27 
 
 		 842 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  32.8 
 
 		 842 aa  85.1  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  23.02 
 
 		 843 aa  84.3  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.44 
 
 		 847 aa  80.9  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  23.85 
 
 		 884 aa  79  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 		 835 aa  77.8  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  27.55 
 
 		 835 aa  77.8  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.5 
 
 		 841 aa  76.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  25.24 
 
 		 867 aa  70.9  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26.5 
 
 		 857 aa  70.1  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  22.01 
 
 		 854 aa  67.8  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  26.5 
 
 		 877 aa  68.2  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 848 aa  67.8  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  26.18 
 
 		 877 aa  67  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0387  putative ABC transporter, permease protein  23.91 
 
 		 856 aa  67.4  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  23.67 
 
 		 861 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0199  hypothetical protein  25.59 
 
 		 851 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  27.34 
 
 		 842 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  22.59 
 
 		 842 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 849 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  22.56 
 
 		 855 aa  61.2  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  24.51 
 
 		 821 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 		 856 aa  58.9  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0530  hypothetical protein  25.09 
 
 		 864 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  29.2 
 
 		 834 aa  55.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0192  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 		 856 aa  54.7  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  22.66 
 
 		 422 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 866 aa  53.9  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>