More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0276 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0922  5-aminolevulinate synthase  80.93 
 
 		 409 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0242  5-aminolevulinate synthase  95.11 
 
 		 409 aa  811    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4563  5-aminolevulinate synthase  82.4 
 
 		 409 aa  716    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4824  5-aminolevulinate synthase  83.86 
 
 		 409 aa  714    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0838  5-aminolevulinate synthase  81.66 
 
 		 409 aa  716    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.876251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0276  5-aminolevulinate synthase  100 
 
 		 409 aa  848    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121176  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0861  5-aminolevulinate synthase  86.31 
 
 		 409 aa  743    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787076  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4023  5-aminolevulinate synthase  78.24 
 
 		 410 aa  690    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1944  5-aminolevulinate synthase  70.59 
 
 		 462 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0844542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2643  5-aminolevulinate synthase  71.01 
 
 		 414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734414  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3442  5-aminolevulinate synthase  70.52 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00024309 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1989  5-aminolevulinate synthase  69.61 
 
 		 462 aa  568  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2266  5-aminolevulinate synthase  69.61 
 
 		 462 aa  568  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2107  5-aminolevulinate synthase  72.5 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4932  5-aminolevulinate synthase  72.5 
 
 		 414 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.014322  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0319  5-aminolevulinate synthase  69.14 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0088  5-aminolevulinate synthase  68.16 
 
 		 425 aa  567  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0335  5-aminolevulinate synthase  68.89 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0412  5-aminolevulinate synthase  68.75 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3508  5-aminolevulinate synthase  70.68 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2126  5-aminolevulinate synthase  66.25 
 
 		 430 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3210  5-aminolevulinate synthase  66.91 
 
 		 435 aa  537  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.679442  normal  0.861336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1167  5-aminolevulinate synthase  63.95 
 
 		 439 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0761593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3823  5-aminolevulinate synthase  59.9 
 
 		 404 aa  518  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0182786  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1797  5-aminolevulinate synthase  59.55 
 
 		 406 aa  520  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2905  5-aminolevulinate synthase  60.61 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0410765  hitchhiker  0.000282174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1206  5-aminolevulinate synthase  59.55 
 
 		 406 aa  512  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.41592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5271  5-aminolevulinate synthase  61.65 
 
 		 405 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.702119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4085  5-aminolevulinate synthase  60.65 
 
 		 404 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3730  5-aminolevulinate synthase  62.16 
 
 		 403 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4804  5-aminolevulinate synthase  61.4 
 
 		 423 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  0.145905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6405  5-aminolevulinate synthase  59.9 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1325  5-aminolevulinate synthase  59.65 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0148844  normal  0.108489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3724  5-aminolevulinate synthase  60.9 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00666631  hitchhiker  0.00153498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5349  5-aminolevulinate synthase  61.15 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3049  5-aminolevulinate synthase  60.25 
 
 		 408 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1540  5-aminolevulinate synthase  60.96 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.280894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3912  5-aminolevulinate synthase  60.65 
 
 		 404 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.258859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1836  5-aminolevulinate synthase  60.79 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0317115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3624  5-aminolevulinate synthase  60.4 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576117  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3969  5-aminolevulinate synthase  60.15 
 
 		 403 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0108645  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3190  5-aminolevulinate synthase  60.9 
 
 		 407 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2880  5-aminolevulinate synthase  60.15 
 
 		 406 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1742  5-aminolevulinate synthase  59.15 
 
 		 403 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3755  5-aminolevulinate synthase  56.6 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.940743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0860  5-aminolevulinate synthase  57.22 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.63511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3028  5-aminolevulinate synthase  54.43 
 
 		 407 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2508  5-aminolevulinate synthase  58.06 
 
 		 404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1933  5-aminolevulinate synthase  56.33 
 
 		 434 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2984  5-aminolevulinate synthase  55.81 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.133808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2030  5-aminolevulinate synthase  54.77 
 
 		 408 aa  462  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1863  5-aminolevulinate synthase  55 
 
 		 407 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0165705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1630  5-aminolevulinate synthase  55.81 
 
 		 407 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.138715  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1182  5-aminolevulinate synthase  55 
 
 		 407 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.489366 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1822  5-aminolevulinate synthase  55.97 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00107702  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0056  5-aminolevulinate synthase  53.27 
 
 		 398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0149  5-aminolevulinate synthase  55.56 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0826  5-aminolevulinate synthase  54.29 
 
 		 406 aa  451  1e-125  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.406774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0092  5-aminolevulinate synthase  51.38 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.3402  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1279  5-aminolevulinate synthase  50.37 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3546  5-aminolevulinate synthase  54.8 
 
 		 404 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.676402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1146  5-aminolevulinate synthase  54.16 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0527812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2301  5-aminolevulinate synthase  54.85 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02284  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.1.37)(5-aminolevulinic acid synthase)(Delta-aminolevulinate synthase)(Delta-ALA synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P38092]  49.16 
 
 		 648 aa  416  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.946393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04260  5-aminolevulinate synthase, putative  47.12 
 
 		 608 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271315  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0516  5-aminolevulinate synthase  49.88 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.554145 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0044  5-aminolevulinate synthase  52.33 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89623  5-aminolevulinate synthase, mitochondrial precursor (5-aminolevulinic acid synthase) (Delta-aminolevulinate synthase) (Delta-ALA synthetase)  46.99 
 
 		 573 aa  387  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1830  5-aminolevulinate synthase  47.34 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9236  5-aminolevulinate synthase  46.15 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.52 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.79 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.41 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.29 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6614  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.52 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0794675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.87 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.54 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3949  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.92 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2816  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.64 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4228  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.31 
 
 		 395 aa  227  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.323305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4187  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.92 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  36.57 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1009  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.92 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.35 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.96 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3919  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  37.57 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0458222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3138  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.46 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.743244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0601  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.51 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1029  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.42 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4251  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.95 
 
 		 394 aa  223  6e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7064  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.1 
 
 		 394 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2435  8-amino-7-oxononanoate synthase  38.57 
 
 		 391 aa  223  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6894  8-amino-7-oxononanoate synthase  39.09 
 
 		 399 aa  222  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0393  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.78 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221946  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3873  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.12 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.77 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4839  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.41 
 
 		 390 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03185  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.78 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05990  8-amino-7-oxononanoate synthase  37.15 
 
 		 391 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4141  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.85 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>