More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0230 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0110  histidine kinase  90.09 
 
 		 446 aa  778    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0152985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7659  histidine kinase  74.22 
 
 		 449 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0060  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  73.41 
 
 		 440 aa  644    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0359  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  77.7 
 
 		 440 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  72.05 
 
 		 440 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 464 aa  933    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.81 
 
 		 440 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.24 
 
 		 444 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.0681596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.52 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0322  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.21 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0381069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1835  histidine kinase  52.37 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426972  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.3 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4042  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.41 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  46.99 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.53 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.1 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.61 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289635  decreased coverage  0.00139676 
 
 
-
 
NC_004310  BR0133  sensor histidine kinase  46.95 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0128  sensor histidine kinase  46.95 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00320906  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0064  two component sensor kinase  46.74 
 
 		 434 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.77 
 
 		 468 aa  359  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.89 
 
 		 464 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0338625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0595  ATPase domain-containing protein  49.07 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0606  histidine kinase  49.07 
 
 		 464 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0907998  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  41.44 
 
 		 462 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 462 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 462 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 465 aa  300  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.916749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4060  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 		 474 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3432  sensor histidine kinase RegB  38.52 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2864  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0537405  normal  0.483733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 466 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 417 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  29.01 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 420 aa  151  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  30.65 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  27.86 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  28.57 
 
 		 465 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  29.02 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 426 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  29.31 
 
 		 426 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 423 aa  136  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 430 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  29.09 
 
 		 426 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  27.97 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  27.63 
 
 		 449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  29.81 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  25.84 
 
 		 449 aa  130  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 449 aa  130  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 467 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  27.77 
 
 		 451 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 435 aa  126  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  29.68 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  28.43 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  27.39 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  27.99 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 479 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.04 
 
 		 448 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 452 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 418 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  24.16 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  28.7 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  26.52 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  25.55 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  23.13 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  26.38 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.38 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  23.8 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 714 aa  78.2  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>