42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0221 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0221  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0137  hypothetical protein  73.12 
 
 		 253 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0766  hypothetical protein  62.65 
 
 		 252 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0644448  hitchhiker  0.00367044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4911  hypothetical protein  63.11 
 
 		 254 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.797649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0789  hypothetical protein  62 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161897  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0900  hypothetical protein  60.4 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5253  hypothetical protein  59.2 
 
 		 259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.209286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  32.61 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  32.2 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  32.2 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  32.42 
 
 		 275 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  34.98 
 
 		 279 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2374  hypothetical protein  34.64 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.511198  hitchhiker  0.00086593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4910  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.17 
 
 		 329 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  31.31 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0790  lipolytic protein  33.7 
 
 		 318 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0841274  normal  0.111603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0929  hypothetical protein  33.15 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.352041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0988  hypothetical protein  33.89 
 
 		 328 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.552823  normal  0.477663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0951  hypothetical protein  33.7 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5252  lipolytic protein G-D-S-L family  30.37 
 
 		 322 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4554  lipolytic protein G-D-S-L family  32.84 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4183  GDSL family lipase  32.84 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4697  lipolytic protein G-D-S-L family  32.26 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0767  putative esterase/acetylhydrolase  32.14 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.0045869  hitchhiker  0.00361745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0901  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.2 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0220  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.64 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2189  GDSL family lipase  31.64 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00786475  normal  0.715805 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0138  lysophospholipase L1 and related esterase  29.06 
 
 		 327 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.465683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1996  GDSL family lipase  30.37 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2227  lipolytic protein G-D-S-L family  33.52 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.452033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5560  hypothetical protein  29.55 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.515693  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1136  lipolytic protein G-D-S-L family  22.33 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.527097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  32.64 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0284  lipolytic protein  29.45 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0286898 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0087  GDSL family lipase  33.04 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3412  arylesterase  33.33 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.634502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0197  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.14 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0389  multifunctional acyl-CoA thioesterase I  26.71 
 
 		 210 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157176  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  28.86 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0416  lysophospholipase L1 and related esterase  27.5 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  28.3 
 
 		 202 aa  42  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>