More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0219 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  91.65 
 
 		 397 aa  759    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  83.68 
 
 		 402 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  83.12 
 
 		 408 aa  668    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  80.4 
 
 		 403 aa  659    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4904  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  81.07 
 
 		 401 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.247924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  83.38 
 
 		 408 aa  671    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 		 422 aa  870    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0471  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  70.34 
 
 		 406 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.706891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1038  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  68.31 
 
 		 408 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  65.28 
 
 		 396 aa  541  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0098  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.58 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0133  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.68 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.765641  normal  0.668156 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.08 
 
 		 398 aa  531  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  64.08 
 
 		 401 aa  531  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0190  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.92 
 
 		 394 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0949182  normal  0.567401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  66.67 
 
 		 406 aa  534  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0398  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  62.98 
 
 		 397 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0180  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  63.66 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.921077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0544  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.44 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.26 
 
 		 394 aa  481  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.88 
 
 		 395 aa  481  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.46 
 
 		 400 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  58.82 
 
 		 392 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.38 
 
 		 397 aa  477  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1661  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.33 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0500  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.98 
 
 		 393 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.960396  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1851  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.66 
 
 		 404 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225194  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.54 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3214  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.53 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  52.21 
 
 		 414 aa  431  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  52.82 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.23 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.23 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.5 
 
 		 412 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0638  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.71 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121257  normal  0.711879 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.94 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.91 
 
 		 417 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.24 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4034  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.42 
 
 		 404 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.5 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.83 
 
 		 406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2393  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.78 
 
 		 404 aa  401  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.168744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.74 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.26 
 
 		 419 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1086  cystathionine gamma-synthase  50.13 
 
 		 401 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.91 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.57 
 
 		 389 aa  393  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.91 
 
 		 404 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3120  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.34 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.69 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.03 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  52.07 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0536  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  49.22 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.84 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3476  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50.27 
 
 		 399 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.84 
 
 		 405 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.84 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.84 
 
 		 423 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.58 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.58 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.58 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.58 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.69 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.94 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.42 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.56 
 
 		 404 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.68 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.18 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.25 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.26 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.82 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.25 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.42 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.74 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.42 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.67 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.64 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.4 
 
 		 402 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.88 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.81 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.74 
 
 		 396 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.3 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.31 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.64 
 
 		 403 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.39 
 
 		 391 aa  362  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  45.03 
 
 		 388 aa  359  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.99 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.03 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  44.87 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.99 
 
 		 401 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.42 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.55 
 
 		 397 aa  354  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.64 
 
 		 403 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.64 
 
 		 403 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.59 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.38 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.38 
 
 		 403 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.9 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.49 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>