31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0190 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  785    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  60.17 
 
 		 366 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  29.38 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  24.7 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  35.08 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  25.37 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  24.06 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  28.21 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  30.54 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  29.14 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  28.32 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  28.82 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  28.24 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  27.18 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  29.78 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  25.82 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  26.87 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  24.87 
 
 		 366 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  33.72 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  26.58 
 
 		 373 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  34.34 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  24.32 
 
 		 347 aa  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  21.59 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  22.92 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  22.1 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1791  hypothetical protein  28.49 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.344205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  28.85 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  27.27 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  23.62 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  23.94 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>