213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0167 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0167  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
143 aa  291  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0211  heat shock protein Hsp20  93.01 
 
 
141 aa  269  8.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0115  putative small heat shock protein  93.71 
 
 
141 aa  265  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.652181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0409  heat shock protein Hsp20  90.91 
 
 
141 aa  264  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0651  heat shock protein Hsp20  90.91 
 
 
141 aa  262  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0518672 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0182  heat shock protein Hsp20  89.51 
 
 
141 aa  261  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0056  heat shock protein Hsp20  88.81 
 
 
141 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4738  heat shock protein Hsp20  71.53 
 
 
144 aa  201  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1616  heat shock protein Hsp20  72.14 
 
 
143 aa  200  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0212201  hitchhiker  0.00491481 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4228  heat shock protein Hsp20  72.86 
 
 
144 aa  200  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00904113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1902  heat shock protein Hsp20  72.14 
 
 
143 aa  199  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1620  heat shock protein Hsp20  72.14 
 
 
143 aa  199  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0107266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0512  heat shock protein Hsp20  69.29 
 
 
166 aa  195  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0010  heat shock protein Hsp20  67.14 
 
 
141 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0049  heat shock protein Hsp20  65.03 
 
 
143 aa  191  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000515794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0010  heat shock protein Hsp20  67.14 
 
 
141 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.138244  normal  0.090985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3162  heat shock protein Hsp20  68.79 
 
 
142 aa  190  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.866915  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2032  heat shock protein Hsp20  69.29 
 
 
141 aa  187  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0174  heat shock protein Hsp20  64.03 
 
 
140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743685  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3663  heat shock protein Hsp20  62.5 
 
 
141 aa  179  8.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.728714  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0188  heat shock protein Hsp20  61.7 
 
 
148 aa  179  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.822794  normal  0.424528 
 
 
-
 
NC_004310  BR0163  HSP20 family protein  61.87 
 
 
160 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0157  HSP20 family protein  61.87 
 
 
160 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183636  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2205  heat shock protein Hsp20  53.9 
 
 
136 aa  150  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0408  heat shock protein Hsp20  56.2 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3755  heat shock protein Hsp20  57.04 
 
 
182 aa  144  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0683  heat shock protein  52.82 
 
 
147 aa  140  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0489966  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3350  heat shock protein Hsp20  51.77 
 
 
172 aa  140  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0341  heat shock protein Hsp20  56.2 
 
 
162 aa  139  9e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0137519  normal  0.0838875 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1372  heat shock protein HSP20  54.89 
 
 
132 aa  135  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4963  heat shock protein Hsp20  52.08 
 
 
141 aa  133  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971356  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0447  small heat shock protein  46.85 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0610  heat shock protein Hsp20  51.75 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.127052  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1572  HSP20 family protein  47.18 
 
 
155 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.583414  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0224  heat shock protein Hsp20  47.18 
 
 
155 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.953259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3054  heat shock protein Hsp20  47.18 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  47.15 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  46.77 
 
 
147 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1070  heat shock protein Hsp20  45.99 
 
 
156 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0407066  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4636  heat shock protein Hsp20  46.21 
 
 
158 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  45.53 
 
 
145 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2632  heat shock protein Hsp20  48.36 
 
 
153 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.734459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  44.72 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  44.72 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  44.72 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  44.72 
 
 
147 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  44.35 
 
 
160 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  46.83 
 
 
155 aa  100  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  46.83 
 
 
155 aa  100  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  44.7 
 
 
144 aa  100  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  45.53 
 
 
146 aa  100  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0619  heat shock protein Hsp20  44.8 
 
 
176 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  43.09 
 
 
147 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 
147 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 
147 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 
147 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  46.34 
 
 
157 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2014  heat shock protein Hsp20  43.28 
 
 
153 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.918897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  42.86 
 
 
159 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  43.9 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  43.44 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  43.44 
 
 
145 aa  97.4  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  44.83 
 
 
154 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  43.2 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2498  heat shock protein Hsp20  42.74 
 
 
155 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0957  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.634441  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  45.67 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4533  heat shock protein Hsp20  42.11 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1139  heat shock protein Hsp20  42.86 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  45.24 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2073  heat shock protein Hsp20  47.15 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1322  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  45.24 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0614  Hsp20/alpha crystallin family protein  42.14 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300096  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  45.24 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  43.28 
 
 
160 aa  94.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1116  heat shock protein Hsp20  46.72 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109039  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2936  heat shock protein Hsp20  43.44 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  45.74 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  42.42 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 
164 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 
160 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  43.09 
 
 
160 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2952  heat shock protein Hsp20  41.35 
 
 
153 aa  93.6  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2117  heat shock protein Hsp20  42.62 
 
 
154 aa  93.6  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4279  heat shock protein Hsp20  42.06 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  42.28 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  41.6 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5227  heat shock protein Hsp20  41.94 
 
 
158 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0487576  normal  0.385827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0384  heat shock protein Hsp20  43.07 
 
 
169 aa  92.8  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.502047  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  42.28 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  43.51 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  43.55 
 
 
137 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  43.55 
 
 
137 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  43.55 
 
 
158 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  43.55 
 
 
137 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  43.55 
 
 
137 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0872  heat shock protein Hsp20  41.04 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.790875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1564  heat shock protein Hsp20  41.46 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.403756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  42.11 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>