More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0159 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  93.72 
 
 		 207 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  83.98 
 
 		 207 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  81.16 
 
 		 207 aa  350  5.9999999999999994e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  74.4 
 
 		 207 aa  329  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  71.5 
 
 		 207 aa  300  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  70.5 
 
 		 206 aa  297  8e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  71.08 
 
 		 206 aa  295  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  71.07 
 
 		 211 aa  295  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  70.85 
 
 		 206 aa  295  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  71.07 
 
 		 211 aa  295  4e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  71 
 
 		 208 aa  295  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  70.59 
 
 		 206 aa  294  8e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  71.57 
 
 		 211 aa  293  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  71 
 
 		 208 aa  291  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  68.5 
 
 		 212 aa  287  8e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  68.5 
 
 		 212 aa  287  8e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  70.05 
 
 		 211 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  68 
 
 		 212 aa  284  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  68.5 
 
 		 212 aa  283  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  69.04 
 
 		 206 aa  282  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  66.16 
 
 		 210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  63.32 
 
 		 206 aa  271  5.000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  57 
 
 		 213 aa  237  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  59.16 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  58.64 
 
 		 212 aa  221  7e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  57.36 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  51.39 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  55.67 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  49.78 
 
 		 228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  49.78 
 
 		 228 aa  214  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  50.93 
 
 		 248 aa  214  9e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  49.55 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  50.9 
 
 		 253 aa  211  4.9999999999999996e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  56.38 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  48.65 
 
 		 247 aa  207  9e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  48.65 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  48.65 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  50.9 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  48.89 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  48.23 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  48.84 
 
 		 293 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  49.07 
 
 		 436 aa  201  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  49.54 
 
 		 249 aa  201  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  47.22 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  50.22 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  48.44 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  48.37 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  48.62 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.22 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 247 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  47.22 
 
 		 247 aa  197  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  47.69 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  47.22 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 247 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  47.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  47.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  46.85 
 
 		 248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  47.51 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  49.54 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  46.3 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  47.69 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  47.56 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  48.91 
 
 		 237 aa  195  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  47.51 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  48.88 
 
 		 249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  49.77 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  49.07 
 
 		 251 aa  194  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  48.13 
 
 		 248 aa  194  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  48.42 
 
 		 250 aa  194  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  48.15 
 
 		 249 aa  194  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  47.66 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0179  phosphoglycerate mutase 1 family  52 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00124281  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  48.87 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  52.26 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  49.54 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  49.07 
 
 		 247 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  45 
 
 		 237 aa  192  2e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 251 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  46.85 
 
 		 230 aa  191  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 251 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  46.29 
 
 		 233 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  45.37 
 
 		 267 aa  191  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  46.76 
 
 		 251 aa  191  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1210  phosphoglycerate mutase 1 family protein  49.56 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.727202  normal  0.54379 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  46.61 
 
 		 250 aa  191  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  47.69 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  47.25 
 
 		 250 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  46.15 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>