More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0153 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 203 aa  408  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  87.98 
 
 		 197 aa  333  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  78.79 
 
 		 207 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  78.76 
 
 		 205 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  78.87 
 
 		 206 aa  311  4.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  78.46 
 
 		 206 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  79.14 
 
 		 206 aa  308  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  66.46 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  62.05 
 
 		 210 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  63.58 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  61.67 
 
 		 204 aa  221  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  65.84 
 
 		 222 aa  218  6e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  63.69 
 
 		 217 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  65.56 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  61.64 
 
 		 204 aa  214  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  62.58 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  62.58 
 
 		 202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  65.75 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  53.27 
 
 		 226 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  57.87 
 
 		 187 aa  208  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  62.18 
 
 		 230 aa  207  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  63.33 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  61.54 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  59.63 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  52.43 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  48.08 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  44.23 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  50.64 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  46.54 
 
 		 240 aa  145  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  46.1 
 
 		 157 aa  144  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  47.65 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  45.09 
 
 		 181 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  46.2 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 186 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  46.15 
 
 		 186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  50.66 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  48.37 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  47.65 
 
 		 181 aa  134  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  43.04 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  40.52 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  42.76 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  44.08 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  44.3 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  43.14 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  42.18 
 
 		 201 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  41.89 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  42.14 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  46.05 
 
 		 188 aa  126  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  40.94 
 
 		 181 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 206 aa  124  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  42.57 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  43.33 
 
 		 194 aa  123  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  42.48 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  43.51 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  41.83 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  39.1 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  35.9 
 
 		 209 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  43.23 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 212 aa  118  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  36.84 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  40.33 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  36.69 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  42.58 
 
 		 202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  40.85 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  39.87 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  41.1 
 
 		 192 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.97 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  42.18 
 
 		 260 aa  114  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  41.5 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3837  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  34.74 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.36 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  39.61 
 
 		 190 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  44.52 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3010  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 250 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3324  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  36.71 
 
 		 245 aa  111  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2828  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 241 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000182531  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3280  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 185 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  36.13 
 
 		 195 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2897  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 196 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2877  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 196 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2895  heat shock protein GrpE  36.81 
 
 		 196 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.804576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  37.42 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  39.46 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  42.33 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  40.25 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  43.15 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>