251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0121 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0121  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.57821  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0127  ATP-dependent protease peptidase subunit  96.15 
 
 		 184 aa  356  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.298064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0303  ATP-dependent protease peptidase subunit  94.92 
 
 		 190 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0149  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.21 
 
 		 186 aa  343  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0404  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.62 
 
 		 187 aa  324  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.37323  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  93.18 
 
 		 193 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0310  ATP-dependent protease peptidase subunit  91.53 
 
 		 189 aa  317  6e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.82 
 
 		 186 aa  294  6e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 176 aa  293  7e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.68 
 
 		 206 aa  293  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  81.98 
 
 		 176 aa  291  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.81 
 
 		 182 aa  291  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  80.68 
 
 		 186 aa  290  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.37 
 
 		 184 aa  286  8e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0250  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.26 
 
 		 197 aa  284  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.505749  normal  0.814167 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.03 
 
 		 184 aa  283  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  78.16 
 
 		 187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.59 
 
 		 193 aa  281  3.0000000000000004e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.48 
 
 		 184 aa  281  5.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.14 
 
 		 175 aa  277  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4376  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.44 
 
 		 183 aa  276  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2295  ATP-dependent protease peptidase subunit  77.9 
 
 		 182 aa  276  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.29 
 
 		 185 aa  275  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3080  ATP-dependent protease peptidase subunit  79.55 
 
 		 191 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1239  ATP-dependent protease peptidase subunit  76.97 
 
 		 182 aa  270  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426925 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2987  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.45 
 
 		 189 aa  268  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0032  ATP-dependent protease peptidase subunit  74.71 
 
 		 186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4309  ATP-dependent protease peptidase subunit  75.72 
 
 		 175 aa  264  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1594  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.89 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.403262  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.03 
 
 		 182 aa  254  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2558  ATP-dependent protease peptidase subunit  73.94 
 
 		 188 aa  254  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.09 
 
 		 187 aa  249  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.49 
 
 		 199 aa  250  1e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3440  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.57 
 
 		 185 aa  250  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.952306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1189  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.52 
 
 		 184 aa  247  7e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.353132  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0996  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.03 
 
 		 189 aa  246  1e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0804  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.96 
 
 		 189 aa  245  2e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.169738  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.92 
 
 		 204 aa  244  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1531  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.18 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.57 
 
 		 185 aa  244  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.67 
 
 		 183 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0181  ATP-dependent protease peptidase subunit  67.61 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 		 181 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.73 
 
 		 187 aa  239  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2949  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.156382  normal  0.168533 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2791  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.29 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.8 
 
 		 182 aa  238  5e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 178 aa  237  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.25 
 
 		 182 aa  236  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0203  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.2 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0358827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2635  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.79 
 
 		 185 aa  236  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318301  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.56 
 
 		 183 aa  234  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 184 aa  234  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 		 193 aa  234  7e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2991  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 		 181 aa  233  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.56 
 
 		 181 aa  233  9e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0810  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.31 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1459  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 		 181 aa  232  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0176  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.77 
 
 		 188 aa  231  5e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2340  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.84 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0674072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0600  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.059342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0788  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 		 178 aa  227  9e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.33 
 
 		 176 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.45 
 
 		 183 aa  224  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.74 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2541  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.93 
 
 		 188 aa  224  8e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  59.78 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.57 
 
 		 176 aa  223  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.74 
 
 		 175 aa  222  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2248  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.16 
 
 		 185 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3837  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 		 178 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.552553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2545  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 		 196 aa  220  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.16 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  60.89 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0464  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.27 
 
 		 176 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5000  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 176 aa  217  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5050  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 176 aa  217  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 174 aa  217  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 174 aa  217  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 		 174 aa  217  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4874  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.86 
 
 		 176 aa  217  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3436  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.22 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.4 
 
 		 174 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66770  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5790  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.64 
 
 		 182 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 		 174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0375  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 		 174 aa  214  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0004  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.99 
 
 		 184 aa  214  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  61.93 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5140  heat shock protein HslV  63.91 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0395  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.91 
 
 		 176 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.95 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.39 
 
 		 176 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45380  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.49 
 
 		 180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.69 
 
 		 176 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 		 176 aa  212  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>