62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0095 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0095  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0088  hypothetical protein  86.32 
 
 
189 aa  308  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.600446  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0439  hypothetical protein  78.29 
 
 
189 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0176  hypothetical protein  80.23 
 
 
173 aa  265  3e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.754868  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0287  hypothetical protein  72.43 
 
 
187 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0382  hypothetical protein  71.05 
 
 
189 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687515  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0281  hypothetical protein  73.18 
 
 
199 aa  244  5e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1770  hypothetical protein  53.94 
 
 
178 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1577  hypothetical protein  51.32 
 
 
197 aa  155  5e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.0747974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1662  hypothetical protein  53.95 
 
 
197 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.35409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1856  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  50.79 
 
 
197 aa  152  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4106  hypothetical protein  52.87 
 
 
185 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.382148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0228  hypothetical protein  45.57 
 
 
225 aa  140  1e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.202432  normal  0.354498 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1401  hypothetical protein  50.87 
 
 
177 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  51.66 
 
 
177 aa  134  1e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5035  hypothetical protein  46.88 
 
 
170 aa  131  8e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.349078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1286  hypothetical protein  44.77 
 
 
186 aa  130  1e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0966  hypothetical protein  45.34 
 
 
181 aa  130  2e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3635  hypothetical protein  48.89 
 
 
167 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.514742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2007  hypothetical protein  45.45 
 
 
167 aa  127  2e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1930  hypothetical protein  45.45 
 
 
167 aa  127  2e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0043  hypothetical protein  46.38 
 
 
170 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.132531  normal  0.0395538 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0061  hypothetical protein  42.94 
 
 
202 aa  120  1e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0334  hypothetical protein  42.94 
 
 
179 aa  120  2e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0085748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2951  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  119  2e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3130  hypothetical protein  44.3 
 
 
164 aa  114  8e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00016542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2816  hypothetical protein  43.51 
 
 
171 aa  114  1e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3423  hypothetical protein  42.95 
 
 
204 aa  113  2e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3057  hypothetical protein  41.1 
 
 
182 aa  113  2e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4226  hypothetical protein  40.88 
 
 
186 aa  113  2e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3762  hypothetical protein  42.41 
 
 
173 aa  113  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0845  hypothetical protein  44.3 
 
 
164 aa  111  7e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2503  hypothetical protein  44.3 
 
 
164 aa  111  7e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.984407 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2376  hypothetical protein  46.1 
 
 
174 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3790  hypothetical protein  45.81 
 
 
168 aa  107  9e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0049  hypothetical protein  40.4 
 
 
151 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.286188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4087  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.56 
 
 
173 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0041  hypothetical protein  42 
 
 
164 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  1.55161e-05 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0415  hypothetical protein  40 
 
 
192 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.659798  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0547  hypothetical protein  32.14 
 
 
275 aa  73.6  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3257  hypothetical protein  33.76 
 
 
288 aa  73.2  2e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2092  hypothetical protein  34.67 
 
 
295 aa  73.6  2e-12  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1372  hypothetical protein  32.43 
 
 
503 aa  72.8  4e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0697094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2911  hypothetical protein  30.41 
 
 
503 aa  72  7e-12  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.49033e-07 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0966  hypothetical protein  30.67 
 
 
248 aa  68.6  7e-11  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.67 
 
 
314 aa  63.9  2e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1793  hypothetical protein  27.4 
 
 
226 aa  62  6e-09  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0735  hypothetical protein  29.24 
 
 
358 aa  59.7  3e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3678  hypothetical protein  31.17 
 
 
222 aa  57.8  1e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0369739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0337  hypothetical protein  30.06 
 
 
253 aa  56.2  3e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2747  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.69 
 
 
216 aa  55.5  6e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  27.1 
 
 
530 aa  52.8  4e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0431  hypothetical protein  27.06 
 
 
230 aa  52.4  6e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1236  secreted protein  31.85 
 
 
240 aa  50.4  2e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04119  hypothetical protein  30.81 
 
 
248 aa  49.7  4e-05  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4196  hypothetical protein  31.58 
 
 
269 aa  48.5  8e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.606827  normal  0.839395 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0406  hypothetical protein  26.92 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.99368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0397  hypothetical protein  26.92 
 
 
217 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10314  hypothetical protein  21.9 
 
 
218 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0385  hypothetical protein  26.92 
 
 
217 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0310  hypothetical protein  26.63 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0607  cell wall binding repeat-containing protein  29.2 
 
 
454 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>