67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0091 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
339 aa  686  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.296297  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0084  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  82.28 
 
 
258 aa  394  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0134  hypothetical protein  71.43 
 
 
257 aa  355  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0443  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  69.2 
 
 
315 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0378  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  59.08 
 
 
317 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0277  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  70.54 
 
 
280 aa  328  1e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.012946  normal  0.130604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0283  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  69.43 
 
 
313 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1840  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  54.07 
 
 
312 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0335702  normal  0.659808 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0445  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  48.82 
 
 
268 aa  179  5e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0961015  normal  0.0287558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2892  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  47.37 
 
 
332 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3748  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.65 
 
 
302 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0297901  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0329  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  42.22 
 
 
227 aa  175  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014302 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.2 
 
 
313 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4515  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.71 
 
 
314 aa  172  7e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142804  normal  0.254845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4403  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.14 
 
 
315 aa  170  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal  0.226597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4033  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.14 
 
 
315 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0396564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3234  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  46.11 
 
 
216 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1926  hypothetical protein  46.78 
 
 
258 aa  154  3e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2003  hypothetical protein  46.2 
 
 
230 aa  152  6e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3053  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.18 
 
 
220 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661457  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0961  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  45.4 
 
 
230 aa  147  2e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4235  possible lolA type protein  40.99 
 
 
220 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3767  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.73 
 
 
222 aa  140  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.796035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4091  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.57 
 
 
222 aa  137  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1299  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.15 
 
 
243 aa  130  2e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0094  LolA family protein  33.52 
 
 
210 aa  121  2e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2946  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.53 
 
 
221 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.879784  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5008  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.42 
 
 
212 aa  111  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0417  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.3 
 
 
206 aa  99.4  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656484  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2901  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.26 
 
 
212 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3698  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.15 
 
 
221 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1497  putative outer membrane lipoprotein carrier protein  34.68 
 
 
212 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0146  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.68 
 
 
212 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.193487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3116  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.84 
 
 
223 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.71 
 
 
198 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560514  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0058  outer membrane lipoprotein carrier protein  31.29 
 
 
234 aa  89.7  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  2.36321e-07 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0429  twin-arginine translocation pathway signal  33.13 
 
 
203 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0061  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.18 
 
 
198 aa  83.6  4e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0207527  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2541  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.71 
 
 
207 aa  80.1  6e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423269  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2670  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.41 
 
 
206 aa  72.4  1e-11  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3189  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.67 
 
 
228 aa  63.2  6e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.8 
 
 
208 aa  61.2  2e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.03 
 
 
217 aa  58.5  1e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0710  hypothetical protein  26.35 
 
 
171 aa  57  4e-07  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.744618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0119  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.63 
 
 
202 aa  56.2  9e-07  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256615  normal  0.030366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.44 
 
 
236 aa  55.5  1e-06  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.68 
 
 
208 aa  54.3  3e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.68 
 
 
208 aa  54.3  3e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.58 
 
 
214 aa  53.5  4e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1281  outer-membrane lipoproteins carrier protein  34.12 
 
 
211 aa  51.2  3e-05  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.866532  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1342  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.12 
 
 
211 aa  50.8  3e-05  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1053  hypothetical protein  27.19 
 
 
193 aa  48.1  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0568151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.52 
 
 
211 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3585  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.42 
 
 
206 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.46 
 
 
210 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.12 
 
 
208 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1518  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.86 
 
 
273 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.08 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0846  hypothetical protein  21.51 
 
 
193 aa  45.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2658  hypothetical protein  29 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3178  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.85 
 
 
207 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.308735  normal  0.0497193 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.57 
 
 
208 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1571  outer membrane lipoprotein carrier  29.73 
 
 
233 aa  43.9  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.199657  normal  0.807566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3348  outer membrane lipoprotein carrier protein  32.26 
 
 
207 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00496768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.68 
 
 
207 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.86 
 
 
207 aa  42.7  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29.27 
 
 
238 aa  42.7  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0787284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>