More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0089 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0089  aminotransferase, class I and II  100 
 
 
423 aa  847  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.789487  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  83.69 
 
 
423 aa  696  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0132  aminotransferase  75.68 
 
 
404 aa  627  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926406  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0281  aminotransferase class I and II  76.49 
 
 
408 aa  614  1e-174  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0769639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0275  aminotransferase, class I and II  75.36 
 
 
438 aa  603  1e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.224598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0376  aminotransferase, class I and II  75.12 
 
 
420 aa  604  1e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0445  aminotransferase, class I and II  78.5 
 
 
412 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.335861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1842  aminotransferase class I and II  59.29 
 
 
416 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.134959  normal  0.168146 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1301  aminotransferase class I and II  48.64 
 
 
413 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.54822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0427  aminotransferase  47.67 
 
 
393 aa  328  8e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1494  aminotransferase  46.75 
 
 
392 aa  322  8e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0109617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0144  aminotransferase, class I and II  46.49 
 
 
392 aa  321  1e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.680923  normal  0.141638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2899  aminotransferase, class I and II  46.35 
 
 
392 aa  316  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.24547  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2672  aminotransferase, class I and II  48.45 
 
 
397 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4601  aminotransferase class I and II  45.5 
 
 
398 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0060  aminotransferase class I and II  46.88 
 
 
393 aa  309  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119317  hitchhiker  3.2787e-06 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  43.12 
 
 
392 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3706  aminotransferase  41.78 
 
 
460 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  42.23 
 
 
407 aa  280  5e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  41.88 
 
 
398 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  42.01 
 
 
397 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  42.97 
 
 
400 aa  276  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  41.13 
 
 
399 aa  274  2e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0393  succinyldiaminopimelate transaminase  37.94 
 
 
408 aa  274  2e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  39.55 
 
 
409 aa  273  5e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  42.01 
 
 
397 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1480  succinyldiaminopimelate transaminase  41.09 
 
 
402 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0439  succinyldiaminopimelate transaminase  37.07 
 
 
412 aa  269  6e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  41.86 
 
 
399 aa  269  7e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2515  succinyldiaminopimelate transaminase  41.54 
 
 
407 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0252  succinyldiaminopimelate transaminase  41.65 
 
 
401 aa  265  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17030  succinyldiaminopimelate transaminase  40.57 
 
 
402 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  41.34 
 
 
398 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  40.87 
 
 
405 aa  262  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1269  aminotransferase class I and II  39.22 
 
 
395 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.58359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  41.54 
 
 
399 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  42.93 
 
 
397 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  41.84 
 
 
400 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  40.36 
 
 
398 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  39.85 
 
 
399 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  40.57 
 
 
396 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  42.49 
 
 
396 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  39.69 
 
 
398 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  39.49 
 
 
398 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  40.41 
 
 
401 aa  256  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2124  succinyldiaminopimelate transaminase  40.31 
 
 
399 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39020  succinyldiaminopimelate transaminase  40.83 
 
 
398 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0524021  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2193  succinyldiaminopimelate transaminase  40.71 
 
 
397 aa  255  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2720  succinyldiaminopimelate transaminase  40.36 
 
 
403 aa  254  2e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  39.24 
 
 
398 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1930  succinyldiaminopimelate transaminase  41.35 
 
 
420 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  40.36 
 
 
409 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  39.23 
 
 
397 aa  252  8e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2061  succinyldiaminopimelate transaminase  41.35 
 
 
387 aa  252  9e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  40.36 
 
 
399 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5338  succinyldiaminopimelate transaminase  40.1 
 
 
410 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  38.46 
 
 
400 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  40.93 
 
 
398 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2029  succinyldiaminopimelate transaminase  40.1 
 
 
410 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6048  succinyldiaminopimelate transaminase  40.1 
 
 
410 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2048  succinyldiaminopimelate transaminase  40.1 
 
 
410 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1248  succinyldiaminopimelate transaminase  40.1 
 
 
410 aa  246  5e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2017  succinyldiaminopimelate transaminase  39.35 
 
 
420 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1997  succinyldiaminopimelate transaminase  38.48 
 
 
405 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.356902 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2068  succinyldiaminopimelate transaminase  39.09 
 
 
410 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.854431  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2504  succinyldiaminopimelate transaminase  39.09 
 
 
410 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1565  succinyldiaminopimelate transaminase  39.09 
 
 
415 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  39.09 
 
 
410 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3244  succinyldiaminopimelate transaminase  39.09 
 
 
410 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667849  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  37.89 
 
 
417 aa  239  6e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1727  succinyldiaminopimelate transaminase  38.96 
 
 
396 aa  239  6e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.963211  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2448  succinyldiaminopimelate transaminase  38.83 
 
 
410 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.805274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1424  succinyldiaminopimelate transaminase  39.95 
 
 
410 aa  239  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000365494  normal  0.0284066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  38.3 
 
 
405 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  36.8 
 
 
399 aa  236  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1498  aminotransferase class I and II  42.53 
 
 
401 aa  236  8e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.632779  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1821  aminotransferase, classes I and II  42.53 
 
 
406 aa  235  9e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  40.15 
 
 
404 aa  234  1e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2466  succinyldiaminopimelate transaminase  38.05 
 
 
405 aa  235  1e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138526 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  36.55 
 
 
399 aa  234  2e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1813  succinyldiaminopimelate transaminase  38.68 
 
 
402 aa  234  2e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  39.9 
 
 
404 aa  234  2e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1348  succinyldiaminopimelate transaminase  38.75 
 
 
434 aa  233  4e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.248718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  37.22 
 
 
409 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0759  hypothetical protein  35.22 
 
 
378 aa  203  6e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  32.64 
 
 
376 aa  202  8e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  37.16 
 
 
388 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  35.81 
 
 
396 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  35.26 
 
 
383 aa  182  8e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  35.64 
 
 
396 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 
386 aa  174  2e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  33.87 
 
 
388 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  32.98 
 
 
388 aa  173  6e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  35.18 
 
 
405 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  30.85 
 
 
392 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  33.33 
 
 
391 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  31.28 
 
 
389 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  32.08 
 
 
388 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  30.39 
 
 
382 aa  158  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  31.52 
 
 
392 aa  157  5e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>