54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0079 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  100 
 
 
746 aa  1519  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  73.19 
 
 
777 aa  1106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  35.97 
 
 
831 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  35.5 
 
 
396 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  33.62 
 
 
349 aa  155  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  33.12 
 
 
349 aa  140  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  31.07 
 
 
420 aa  136  1e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  32.7 
 
 
427 aa  134  7e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  31.44 
 
 
566 aa  133  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  34.95 
 
 
341 aa  132  2e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  32.51 
 
 
345 aa  132  2e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  31.7 
 
 
523 aa  132  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  33.85 
 
 
344 aa  130  1e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  32.62 
 
 
344 aa  128  4e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  32.51 
 
 
345 aa  127  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  32.51 
 
 
345 aa  127  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  33.13 
 
 
345 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  32.62 
 
 
344 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  31.39 
 
 
406 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  33.23 
 
 
345 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  32.31 
 
 
344 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  32.62 
 
 
345 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  33.44 
 
 
530 aa  123  1e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  31.65 
 
 
424 aa  122  2e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  30.77 
 
 
432 aa  121  5e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  30.94 
 
 
595 aa  120  8e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  30.05 
 
 
407 aa  118  4e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  29.64 
 
 
337 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  27.16 
 
 
371 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  31.14 
 
 
428 aa  117  7e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  29.64 
 
 
337 aa  117  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  31.16 
 
 
407 aa  116  2e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  29.57 
 
 
347 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  27.64 
 
 
721 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  28.53 
 
 
514 aa  105  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  30.33 
 
 
416 aa  102  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  30.92 
 
 
411 aa  100  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  30.64 
 
 
357 aa  98.6  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  29.03 
 
 
364 aa  97.8  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  30.29 
 
 
383 aa  97.4  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  28.03 
 
 
367 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  28.03 
 
 
393 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  28.85 
 
 
367 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  28.8 
 
 
361 aa  94  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 
456 aa  84  9e-15  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  31.02 
 
 
503 aa  75.5  4e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  27.23 
 
 
474 aa  71.6  5e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  29.58 
 
 
520 aa  70.5  1e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  30.23 
 
 
514 aa  70.5  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 
632 aa  67.8  7e-10  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  30.33 
 
 
498 aa  67  1e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  26.02 
 
 
686 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  24.04 
 
 
393 aa  49.3  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0989  hypothetical protein  27.83 
 
 
791 aa  45.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>