35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0068 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  100 
 
 
246 aa  478  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  88.62 
 
 
246 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  77.33 
 
 
251 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  75.2 
 
 
250 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  76.02 
 
 
249 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  75.1 
 
 
248 aa  353  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  75.51 
 
 
247 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  43.65 
 
 
241 aa  174  1e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  43.25 
 
 
241 aa  173  2e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  45.26 
 
 
233 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  40.51 
 
 
237 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  46.03 
 
 
239 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  42.62 
 
 
238 aa  162  4e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  44.02 
 
 
237 aa  159  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  44.02 
 
 
237 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  42.47 
 
 
243 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  42.31 
 
 
242 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  39.66 
 
 
237 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  42.86 
 
 
238 aa  147  1e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  40.74 
 
 
237 aa  147  2e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  37.55 
 
 
235 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  39.5 
 
 
239 aa  144  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  39.5 
 
 
250 aa  127  1e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  38.36 
 
 
231 aa  127  1e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  41.63 
 
 
240 aa  118  8e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  33.05 
 
 
226 aa  118  1e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  32.08 
 
 
227 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  34.6 
 
 
230 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  34.6 
 
 
230 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  40.13 
 
 
231 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  34.04 
 
 
230 aa  95.1  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  31.03 
 
 
236 aa  84.3  2e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  30.72 
 
 
230 aa  78.6  9e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  34.36 
 
 
237 aa  78.2  1e-13  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  30.07 
 
 
249 aa  59.3  5e-08  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>