More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0064 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0064  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  100 
 
 
225 aa  442  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0056  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  85.71 
 
 
225 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.185509  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0098  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  71.03 
 
 
219 aa  302  2e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0196  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  65.89 
 
 
218 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0636  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  67.29 
 
 
218 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0636214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0071  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  65.26 
 
 
213 aa  268  6e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00571088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0393  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  67.76 
 
 
218 aa  266  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0809  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  53.11 
 
 
227 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0667  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  51.17 
 
 
218 aa  213  1e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2926  phosphoribosylanthranilate isomerase  52.25 
 
 
222 aa  211  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.212855  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1692  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  57.14 
 
 
270 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280488  hitchhiker  4.87855e-07 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0202  Phosphoribosylanthranilate isomerase  57 
 
 
215 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0144  phosphoribosylanthranilate isomerase  53.49 
 
 
215 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2027  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  52.63 
 
 
227 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.206326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0177  phosphoribosylanthranilate isomerase  55.33 
 
 
215 aa  199  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3236  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  49.07 
 
 
215 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3953  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  47.14 
 
 
222 aa  195  4e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.132267  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3587  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  52.22 
 
 
215 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.26697  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3885  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  53.14 
 
 
212 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.523686  normal  0.722804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1029  phosphoribosylanthranilate isomerase  54.07 
 
 
228 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96854  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4280  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  46.19 
 
 
222 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3789  phosphoribosylanthranilate isomerase  53.77 
 
 
215 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167739  hitchhiker  0.0064312 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3272  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  51.69 
 
 
212 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.353986 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3587  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  51.69 
 
 
212 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0119  Phosphoribosylanthranilate isomerase  55.84 
 
 
215 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2111  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  52.63 
 
 
222 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3425  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  46.23 
 
 
218 aa  183  2e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0019  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  48.33 
 
 
224 aa  181  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2442  phosphoribosylanthranilate isomerase  57.44 
 
 
219 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0146  Phosphoribosylanthranilate isomerase  54.72 
 
 
242 aa  177  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2506  phosphoribosylanthranilate isomerase  53.73 
 
 
225 aa  173  2e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0660467  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2203  N-(5'phosphoribosyl)anthranilate isomerase (PRAI)  49.76 
 
 
222 aa  164  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1304  phosphoribosylanthranilate isomerase  48.33 
 
 
229 aa  163  2e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330049  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1065  phosphoribosylanthranilate isomerase  45.54 
 
 
213 aa  158  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.660088  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0204  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  44.5 
 
 
215 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.598443  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0094  phosphoribosylanthranilate isomerase  46.34 
 
 
211 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.823636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2035  Phosphoribosylanthranilate isomerase  43.54 
 
 
224 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.11252  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2725  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  41.67 
 
 
217 aa  140  1e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.902512  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4975  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  42.51 
 
 
213 aa  131  8e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1160  Phosphoribosylanthranilate isomerase  40.28 
 
 
251 aa  128  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1722  phosphoribosylanthranilate isomerase  41.15 
 
 
205 aa  126  2e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.214814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1915  phosphoribosylanthranilate isomerase  42.79 
 
 
205 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.370127  normal  0.693187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1559  phosphoribosylanthranilate isomerase  36.06 
 
 
209 aa  124  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2138  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.16 
 
 
233 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.617721  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1814  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.16 
 
 
233 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0442544  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0802  phosphoribosylanthranilate isomerase  37.14 
 
 
212 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0635156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2307  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.05 
 
 
238 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1984  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.65 
 
 
230 aa  121  1e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2468  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.67 
 
 
231 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1267  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  33.5 
 
 
207 aa  117  2e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1050  Phosphoribosylanthranilate isomerase  38.14 
 
 
228 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.392103 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0771  phosphoribosylanthranilate isomerase  40.55 
 
 
224 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1266  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  33.98 
 
 
207 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34210  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.46 
 
 
206 aa  115  4e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2041  phosphoribosylanthranilate isomerase  35.38 
 
 
205 aa  115  4e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1913  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  35.05 
 
 
208 aa  115  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1556  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  39.9 
 
 
206 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0827708  normal  0.291765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1212  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.67 
 
 
205 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1897  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.68 
 
 
204 aa  115  7e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1336  Phosphoribosylanthranilate isomerase  37.12 
 
 
209 aa  114  1e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  0.473314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0754  phosphoribosylanthranilate isomerase  33.95 
 
 
219 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000349409  normal  0.658174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5476  Phosphoribosylanthranilate isomerase  33.8 
 
 
214 aa  111  8e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.766607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2331  phosphoribosylanthranilate isomerase  36.45 
 
 
210 aa  110  1e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3794  Phosphoribosylanthranilate isomerase  29.22 
 
 
216 aa  111  1e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1158  Phosphoribosylanthranilate isomerase  37.56 
 
 
209 aa  111  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3063  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.1 
 
 
207 aa  110  2e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2080  phosphoribosylanthranilate isomerase  34.76 
 
 
206 aa  110  2e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1048  Phosphoribosylanthranilate isomerase  35.98 
 
 
218 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0466  phosphoribosylanthranilate isomerase  33.33 
 
 
227 aa  108  4e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1995  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.46 
 
 
206 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.670825  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1699  phosphoribosylanthranilate isomerase  38.17 
 
 
192 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.219742 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3378  Phosphoribosylanthranilate isomerase  29.85 
 
 
211 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000155816  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3766  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.46 
 
 
206 aa  108  7e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1209  phosphoribosylanthranilate isomerase  31.28 
 
 
207 aa  108  7e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1736  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  35.75 
 
 
203 aa  108  8e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0809  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  33.17 
 
 
205 aa  108  9e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0786  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  33.17 
 
 
205 aa  108  9e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1187  phosphoribosylanthranilate isomerase  38.21 
 
 
204 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00213067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2378  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.71 
 
 
203 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0869  phosphoribosylanthranilate isomerase  37.96 
 
 
208 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1250  Phosphoribosylanthranilate isomerase  33.8 
 
 
208 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2716  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.02 
 
 
217 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539711 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1019  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  34.93 
 
 
206 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1529  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  38.28 
 
 
206 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0459738  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01268  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  34.84 
 
 
222 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.960532  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2126  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.04 
 
 
233 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.639678  decreased coverage  0.00415793 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0770  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.5 
 
 
253 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2446  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.5 
 
 
253 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4032  Phosphoribosylanthranilate isomerase  34.04 
 
 
242 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2308  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.5 
 
 
253 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1565  phosphoribosylanthranilate isomerase  37.56 
 
 
227 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3347  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.57 
 
 
233 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.205386  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3852  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  36.57 
 
 
233 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2158  phosphoribosylanthranilate isomerase  36.44 
 
 
213 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0832153 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1292  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  35.75 
 
 
209 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417181  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1681  phosphoribosylanthranilate isomerase  38.07 
 
 
220 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4049  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  33.18 
 
 
204 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1648  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.5 
 
 
253 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677348  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0457  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  29.9 
 
 
215 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0528  N-(5'-phosphoribosyl)anthranilate isomerase  37.5 
 
 
253 aa  105  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.649184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>