More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0041 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0458  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.39 
 
 
408 aa  676  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.930732  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2228  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  82.35 
 
 
408 aa  705  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413465  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0041  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  100 
 
 
407 aa  836  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0053  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  84.77 
 
 
407 aa  724  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2684  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  81.37 
 
 
408 aa  690  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376136  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0612  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  88.73 
 
 
408 aa  760  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0430  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  88.24 
 
 
408 aa  756  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0495  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.64 
 
 
408 aa  682  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0230579  normal  0.158439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0740  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  81.93 
 
 
407 aa  696  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0332  Beta-ketoacyl synthase  81.08 
 
 
407 aa  687  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.207835 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0033  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  96.31 
 
 
407 aa  815  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_004310  BR2172  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  81.19 
 
 
407 aa  693  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0348  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  89.71 
 
 
408 aa  764  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2205  Beta-ketoacyl synthase  78.38 
 
 
407 aa  667  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0425  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  80.15 
 
 
408 aa  676  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  0.854299 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1269  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  78.22 
 
 
406 aa  673  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2084  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  81.19 
 
 
407 aa  693  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0221  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  89.22 
 
 
408 aa  764  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.188438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0068  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  89.47 
 
 
399 aa  757  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.707372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0383  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  81.86 
 
 
408 aa  700  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3938  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  78.02 
 
 
406 aa  650  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0180  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  76.35 
 
 
407 aa  628  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3449  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  75.92 
 
 
406 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4057  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  73.24 
 
 
410 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4379  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  72.75 
 
 
410 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.913826 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3635  Beta-ketoacyl synthase  71.88 
 
 
408 aa  601  1e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5061  Beta-ketoacyl synthase  70.27 
 
 
404 aa  581  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.390685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2879  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  68.15 
 
 
406 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1650  beta-ketoacyl synthase  67.32 
 
 
409 aa  549  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1009  beta-ketoacyl synthase  67.57 
 
 
409 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1422  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  63.61 
 
 
411 aa  538  1e-152  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.84901e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  67.32 
 
 
404 aa  540  1e-152  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0456  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  66.09 
 
 
405 aa  541  1e-152  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3072  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  63.37 
 
 
403 aa  534  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1475  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  63.37 
 
 
411 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  8.96879e-08  normal  0.430163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1487  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  63.37 
 
 
411 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000399057  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1071  3-ketoacyl-ACP synthase FabB  65.11 
 
 
403 aa  537  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.791562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2746  beta-ketoacyl synthase  63.46 
 
 
411 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  8.48773e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4242  Beta-ketoacyl synthase  64.37 
 
 
404 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0417554  hitchhiker  1.09477e-08 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2840  Beta-ketoacyl synthase  63.46 
 
 
411 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  4.36075e-07  decreased coverage  9.09271e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01194  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase  65.76 
 
 
404 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1995  beta-ketoacyl synthase  63.7 
 
 
404 aa  531  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.566366  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1613  Beta-ketoacyl synthase  63.46 
 
 
411 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  6.87421e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2445  beta-ketoacyl synthase  63.21 
 
 
411 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  4.00584e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2763  Beta-ketoacyl synthase  63.21 
 
 
411 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.80167e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2470  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  64.6 
 
 
406 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2154  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  63.86 
 
 
403 aa  530  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000914217  normal  0.99764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3665  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  64.6 
 
 
405 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1482  beta-ketoacyl synthase  62.87 
 
 
403 aa  524  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.01654e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1391  beta-ketoacyl synthase  62.9 
 
 
412 aa  527  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.482288  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0998  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  63.97 
 
 
405 aa  527  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  3.57653e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  64.11 
 
 
405 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase KASI  64.85 
 
 
403 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.08179e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  65.19 
 
 
407 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03105  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  63.64 
 
 
403 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1777  Beta-ketoacyl synthase  64.44 
 
 
412 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4213  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  64.04 
 
 
406 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.409355  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3498  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  64.11 
 
 
406 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2410  beta-ketoacyl synthase  63.37 
 
 
403 aa  521  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.3213e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1693  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  64.36 
 
 
403 aa  524  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.93384e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3746  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  63.3 
 
 
406 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4175  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  63.55 
 
 
406 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40794  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29060  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  64.11 
 
 
405 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1693  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  63.55 
 
 
406 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1606  Beta-ketoacyl synthase  61.63 
 
 
424 aa  516  1e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  8.86766e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2019  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  63.95 
 
 
407 aa  517  1e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383938  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3807  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I  62.13 
 
 
403 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1373  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  60.34 
 
 
405 aa  511  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1893  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  62.96 
 
 
407 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3935  hypothetical protein  65.28 
 
 
409 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0408211  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1945  Beta-ketoacyl synthase  62.47 
 
 
406 aa  508  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.53136e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3914  beta-ketoacyl synthase  65.04 
 
 
409 aa  507  1e-142  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3177  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  65.04 
 
 
409 aa  507  1e-142  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0665  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  60.99 
 
 
406 aa  498  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.956825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1644  beta-ketoacyl synthase  62.13 
 
 
403 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00348297  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0018  beta-ketoacyl synthase  60.59 
 
 
405 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.83399  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0181  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  59.46 
 
 
409 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3008  Beta-ketoacyl synthase  62.87 
 
 
403 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.753979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3383  beta-ketoacyl synthase  64.11 
 
 
404 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.160836  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0983  Beta-ketoacyl synthase  63.61 
 
 
405 aa  494  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.521852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2701  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.9 
 
 
406 aa  494  1e-138  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2480  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.9 
 
 
406 aa  493  1e-138  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3464  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.9 
 
 
406 aa  493  1e-138  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1329  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.9 
 
 
406 aa  493  1e-138  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318375  normal  0.654586 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2618  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.9 
 
 
406 aa  493  1e-138  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02208  hypothetical protein  62.9 
 
 
406 aa  493  1e-138  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2474  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.9 
 
 
406 aa  493  1e-138  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1333  Beta-ketoacyl synthase  62.9 
 
 
406 aa  493  1e-138  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02248  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase  62.9 
 
 
406 aa  493  1e-138  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2805  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.25 
 
 
405 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.858118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1274  Beta-ketoacyl synthase  59.8 
 
 
407 aa  488  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1656  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase I  59.66 
 
 
409 aa  489  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0361751  normal  0.598458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2607  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.41 
 
 
404 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.883594  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2518  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.41 
 
 
404 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2585  Beta-ketoacyl synthase  62.32 
 
 
405 aa  487  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2620  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.41 
 
 
404 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.280272  hitchhiker  2.02804e-05 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2567  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.41 
 
 
404 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926169  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2731  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.41 
 
 
404 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.21582  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1459  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  62.01 
 
 
405 aa  487  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0426777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2871  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase I  61.37 
 
 
405 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.261855  normal  0.0659143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>