More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0040 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  100 
 
 
282 aa  577  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0032  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  94.58 
 
 
277 aa  539  1e-152  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.236001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0066  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  76.32 
 
 
266 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0431  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  75.47 
 
 
269 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  76.52 
 
 
282 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  74.14 
 
 
282 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0611  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  74.72 
 
 
281 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0222  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  74.72 
 
 
281 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.14 
 
 
284 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.190208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  73.86 
 
 
268 aa  405  1e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2083  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  72.08 
 
 
272 aa  399  1e-110  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.464026  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2171  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  72.08 
 
 
272 aa  399  1e-110  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0741  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.57 
 
 
272 aa  397  1e-110  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.72 
 
 
268 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.8 
 
 
282 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111733  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.11 
 
 
291 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.185416  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.85 
 
 
268 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.43 
 
 
276 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0868707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.43 
 
 
277 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.917513  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.58 
 
 
264 aa  380  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.55 
 
 
275 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26472  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.17 
 
 
275 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.82 
 
 
288 aa  374  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.75394  hitchhiker  0.000398592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2204  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  72.2 
 
 
262 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.17 
 
 
276 aa  371  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1270  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.91 
 
 
272 aa  360  1e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.71 
 
 
279 aa  355  6e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.73 
 
 
272 aa  352  3e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  66.28 
 
 
279 aa  350  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.57 
 
 
272 aa  346  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.57 
 
 
272 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.34 
 
 
272 aa  346  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.95 
 
 
272 aa  344  8e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.4 
 
 
272 aa  342  3e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.57 
 
 
272 aa  342  6e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.84 
 
 
273 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  61.07 
 
 
279 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.02 
 
 
272 aa  337  1e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.31 
 
 
268 aa  337  1e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  3.36187e-06  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  62.02 
 
 
275 aa  336  2e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.77 
 
 
273 aa  337  2e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.84 
 
 
292 aa  336  3e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
282 aa  332  4e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.79 
 
 
272 aa  332  5e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0051  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  60.54 
 
 
267 aa  332  5e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2476  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.92 
 
 
270 aa  331  9e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0264852  normal  0.0112643 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1790  NADH dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  60.77 
 
 
272 aa  329  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00952782  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1019  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.47 
 
 
274 aa  327  1e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350664  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2344  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.47 
 
 
274 aa  327  1e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.187833  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0857  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.18 
 
 
275 aa  327  1e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4810  enoyl-acyl carrier protein reductase  58.43 
 
 
275 aa  327  1e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.368185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4292  enoyl-acyl carrier protein reductase  58.43 
 
 
275 aa  326  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4661  enoyl-acyl carrier protein reductase  58.43 
 
 
275 aa  326  3e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2468  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.7 
 
 
277 aa  325  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.91 
 
 
282 aa  325  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.91 
 
 
274 aa  323  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.98 
 
 
266 aa  322  3e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1657  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  58.02 
 
 
262 aa  322  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  56.92 
 
 
280 aa  320  2e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4769  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  59.77 
 
 
267 aa  320  2e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0134326  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  59.07 
 
 
286 aa  320  2e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  59 
 
 
286 aa  320  2e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.37 
 
 
261 aa  316  3e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0396  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.85 
 
 
272 aa  315  5e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.632907  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0657  enoyl-acyl-carrier-protein reductase  56.13 
 
 
275 aa  313  2e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.45449  normal  0.282453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  55.98 
 
 
274 aa  313  3e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.49 
 
 
262 aa  311  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.25 
 
 
278 aa  297  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0180  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  55.3 
 
 
264 aa  294  9e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26134  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  54.76 
 
 
255 aa  291  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.76058e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.58 
 
 
262 aa  284  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3176  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  57.25 
 
 
262 aa  283  3e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
262 aa  283  3e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.445364  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  53.31 
 
 
259 aa  279  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3934  hypothetical protein  56.11 
 
 
262 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0146062  normal  0.728571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  52.92 
 
 
259 aa  275  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.12 
 
 
271 aa  273  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0351674  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.15 
 
 
256 aa  271  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.38 
 
 
273 aa  271  8e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2558  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  54.33 
 
 
256 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.646059  hitchhiker  1.54465e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.76 
 
 
256 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3058  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  53.46 
 
 
272 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.25 
 
 
262 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
256 aa  266  3e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.486877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.12 
 
 
261 aa  266  3e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
256 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1426  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.59 
 
 
274 aa  265  7e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.37 
 
 
260 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00175995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3620  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  49.42 
 
 
260 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  4.70966e-07  normal  0.0807844 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.2 
 
 
272 aa  263  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.41 
 
 
274 aa  262  5e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 
261 aa  259  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.53 
 
 
256 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.62 
 
 
274 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
254 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1587  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.41 
 
 
274 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0818628  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1751  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.62 
 
 
273 aa  257  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0464231  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1245  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.41 
 
 
273 aa  255  7e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.766036  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0043  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.24 
 
 
265 aa  255  7e-67  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.159183  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0307  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  47.83 
 
 
254 aa  255  7e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00919457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>