More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0039 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
198 aa  404  1e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  88.89 
 
 
198 aa  348  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.68 
 
 
207 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.3 
 
 
205 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  46.56 
 
 
222 aa  163  2e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  45.6 
 
 
222 aa  161  5e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.24 
 
 
204 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  40.72 
 
 
204 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  40.72 
 
 
204 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.18 
 
 
204 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.72 
 
 
204 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.71 
 
 
211 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.01 
 
 
219 aa  147  1e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  39.79 
 
 
215 aa  147  1e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  1.54046e-06 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.58 
 
 
200 aa  145  4e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.47 
 
 
219 aa  144  8e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.14 
 
 
204 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  42.93 
 
 
211 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  41.62 
 
 
206 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.14 
 
 
204 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  40.84 
 
 
214 aa  142  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 
206 aa  141  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  38.74 
 
 
201 aa  140  1e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  39.49 
 
 
213 aa  140  1e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.6 
 
 
213 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 
210 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  37.82 
 
 
214 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  40.31 
 
 
207 aa  134  6e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.58 
 
 
205 aa  134  7e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  39.38 
 
 
210 aa  133  1e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.06 
 
 
213 aa  131  8e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  38.89 
 
 
201 aa  130  1e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  38.89 
 
 
201 aa  129  2e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  38.97 
 
 
211 aa  129  2e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.65 
 
 
227 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  37.88 
 
 
201 aa  129  4e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  36.92 
 
 
208 aa  128  5e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  38.27 
 
 
208 aa  128  7e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.7 
 
 
211 aa  126  2e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.86 
 
 
211 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.2 
 
 
214 aa  120  2e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  33.16 
 
 
213 aa  119  4e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  36.61 
 
 
213 aa  118  5e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.19 
 
 
203 aa  117  8e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  35.42 
 
 
186 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.07 
 
 
213 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  35.42 
 
 
186 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  36.61 
 
 
213 aa  115  4e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  34.62 
 
 
218 aa  113  2e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  33.51 
 
 
185 aa  111  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5803  Glutathione S-transferase domain protein  34.69 
 
 
181 aa  110  1e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  34.11 
 
 
220 aa  110  1e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.5 
 
 
207 aa  108  7e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.59 
 
 
202 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 
207 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  31 
 
 
202 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  32.64 
 
 
183 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  29.81 
 
 
216 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0508  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.51 
 
 
213 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.553974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  35 
 
 
207 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
210 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.45 
 
 
213 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  38.1 
 
 
208 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
210 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
210 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  33.13 
 
 
211 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  31.08 
 
 
210 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1256  glutathione S-transferase  33.51 
 
 
184 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.522192  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  31.37 
 
 
217 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001312  glutathione S-transferase  32.02 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.2 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3119  putative glutathione S-transferase  33.51 
 
 
207 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427542  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.68 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  31.5 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0966  Glutathione S-transferase domain protein  31.55 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  32.66 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.02 
 
 
220 aa  95.9  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0783  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
209 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0755  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.76216  normal  0.189515 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  32.84 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0806  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
206 aa  94.4  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05193  glutathione S-transferase III  31.22 
 
 
205 aa  94.4  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2249  glutathione S-transferase-like protein  32.86 
 
 
222 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0626984 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  32.84 
 
 
209 aa  94  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3183  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.413955  normal  0.024534 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.6 
 
 
199 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3847  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.6 
 
 
233 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948042  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3680  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.6 
 
 
233 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382886  normal  0.017552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0359  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.02 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00589351  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0014  glutathione S-transferase-like protein  31.82 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198681  normal  0.0539534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4925  Glutathione S-transferase domain protein  30.54 
 
 
223 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4517  glutathione S-transferase-like  31.6 
 
 
233 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.31 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  31.4 
 
 
229 aa  92  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
215 aa  92  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  33.01 
 
 
208 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2563  Glutathione S-transferase domain protein  32.7 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>