More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0025 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  72.13 
 
 
536 aa  755  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  73.8 
 
 
536 aa  776  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  87.87 
 
 
535 aa  942  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  74.95 
 
 
534 aa  793  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  73.85 
 
 
536 aa  781  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
541 aa  1069  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  75.57 
 
 
536 aa  800  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1814  apolipoprotein N-acyltransferase  49.08 
 
 
540 aa  448  1e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136968  normal  0.226792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  48.5 
 
 
556 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3208  apolipoprotein N-acyltransferase  49.54 
 
 
567 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122216  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  45.96 
 
 
557 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3532  apolipoprotein N-acyltransferase  49.54 
 
 
567 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212796  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  50.59 
 
 
553 aa  418  1e-115  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2893  apolipoprotein N-acyltransferase  47.29 
 
 
576 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.240841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3403  apolipoprotein N-acyltransferase  50.84 
 
 
566 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.72267  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  45.6 
 
 
532 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  44.11 
 
 
532 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  46.59 
 
 
543 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  45.4 
 
 
532 aa  407  1e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1059  apolipoprotein N-acyltransferase  44.98 
 
 
550 aa  408  1e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.130315  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  45.25 
 
 
534 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  45.44 
 
 
534 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  43.09 
 
 
528 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  42.51 
 
 
543 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  4.81156e-12 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  39.54 
 
 
541 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  42.04 
 
 
523 aa  315  2e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  42.04 
 
 
523 aa  315  2e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  38.36 
 
 
531 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  36.95 
 
 
537 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0178  apolipoprotein N-acyltransferase  33.53 
 
 
501 aa  275  1e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  35.01 
 
 
502 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0120  apolipoprotein N-acyltransferase  32.79 
 
 
488 aa  258  2e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  36.97 
 
 
487 aa  253  8e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  38.95 
 
 
495 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  36.56 
 
 
528 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0192  apolipoprotein N-acyltransferase  38.31 
 
 
508 aa  247  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  38.13 
 
 
495 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2103  apolipoprotein N-acyltransferase  35.29 
 
 
525 aa  240  6e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  35.6 
 
 
497 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  36.98 
 
 
495 aa  234  2e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  34.82 
 
 
472 aa  231  2e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0285  apolipoprotein N-acyltransferase  35.45 
 
 
522 aa  221  2e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.81 
 
 
573 aa  207  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  33.89 
 
 
506 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  32.38 
 
 
513 aa  194  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  32.82 
 
 
507 aa  193  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  31.78 
 
 
537 aa  192  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  32.88 
 
 
509 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3374  apolipoprotein N-acyltransferase  30.81 
 
 
588 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0635082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  32.09 
 
 
507 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  31.73 
 
 
518 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  32.75 
 
 
521 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  31.32 
 
 
518 aa  184  4e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  31.97 
 
 
516 aa  184  4e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  32.33 
 
 
511 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  32.34 
 
 
509 aa  181  3e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  32.04 
 
 
519 aa  181  3e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  31.85 
 
 
516 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0020  apolipoprotein N-acyltransferase  34.35 
 
 
509 aa  179  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  31.72 
 
 
515 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  2.54581e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  30.22 
 
 
512 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  30.88 
 
 
510 aa  179  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1102  apolipoprotein N-acyltransferase  31.73 
 
 
524 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49878e-09 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  37.07 
 
 
524 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  33.15 
 
 
515 aa  177  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  33.15 
 
 
515 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  33.15 
 
 
515 aa  177  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 
510 aa  177  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  33.02 
 
 
542 aa  177  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.27 
 
 
514 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  27.08 
 
 
523 aa  176  1e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  30.22 
 
 
529 aa  175  2e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  31.13 
 
 
516 aa  175  2e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3265  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
524 aa  174  3e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  32.08 
 
 
479 aa  174  3e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  26.1 
 
 
524 aa  174  3e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
532 aa  174  3e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  8.38838e-07  hitchhiker  2.62387e-05 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  29.57 
 
 
529 aa  174  3e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3443  apolipoprotein N-acyltransferase  31.37 
 
 
524 aa  174  3e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768498 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  27.75 
 
 
501 aa  173  7e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  31.09 
 
 
525 aa  173  8e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  29.57 
 
 
529 aa  173  8e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
529 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3307  apolipoprotein N-acyltransferase  32.13 
 
 
524 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
529 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  31.46 
 
 
502 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  29.94 
 
 
506 aa  172  2e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3475  apolipoprotein N-acyltransferase  31.04 
 
 
519 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2616  apolipoprotein N-acyltransferase  32.18 
 
 
562 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244944  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  32.33 
 
 
509 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  33.9 
 
 
477 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2751  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 
562 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  32.68 
 
 
510 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
512 aa  171  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  31.21 
 
 
506 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
512 aa  170  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0531  apolipoprotein N-acyltransferase  28.21 
 
 
524 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0307226  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
512 aa  170  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  31.37 
 
 
509 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  29.3 
 
 
492 aa  169  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>