More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0019 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0019  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  100 
 
 
160 aa  320  5e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0323693  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0012  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  87.5 
 
 
160 aa  281  3e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.193132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  75 
 
 
160 aa  238  3e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0465  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  68.1 
 
 
161 aa  214  3e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.534305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0455  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  66.26 
 
 
161 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  61.96 
 
 
161 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0587  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  63.19 
 
 
161 aa  200  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0642  GCN5-related N-acetyltransferase  44.03 
 
 
171 aa  109  1e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.86161  normal  0.704084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3396  GCN5-related N-acetyltransferase  43.88 
 
 
173 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4431  GCN5-related N-acetyltransferase  44.08 
 
 
160 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110748  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3524  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 
173 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193717  normal  0.0893278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3200  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
150 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.358197  normal  0.871545 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0862  GCN5-related N-acetyltransferase  46.32 
 
 
138 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2898  GCN5-related N-acetyltransferase  41.91 
 
 
163 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.288447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1821  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42 
 
 
158 aa  97.1  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.477403  normal  0.159791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.92 
 
 
160 aa  90.5  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.242864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0760  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.58 
 
 
170 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.757602  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2151  acetyltransferase  35.37 
 
 
166 aa  81.6  4e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2064  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.37 
 
 
166 aa  81.6  4e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.224111  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.96 
 
 
139 aa  81.3  6e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0433  acetyltransferase  34.03 
 
 
165 aa  79  3e-14  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1990  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35.21 
 
 
160 aa  77.8  6e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2281  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 
160 aa  77.8  6e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343647  normal  0.565738 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
153 aa  77.4  8e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2098  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
166 aa  76.3  2e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.907585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0038  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 
167 aa  75.9  2e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42621e-06 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
163 aa  74.3  6e-13  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0887  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.06 
 
 
160 aa  73.9  7e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14178  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2212  putative acetyltransferase  38.06 
 
 
160 aa  73.9  8e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.1 
 
 
160 aa  73.9  9e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1242  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.21 
 
 
163 aa  73.6  1e-12  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0022  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
164 aa  72.4  2e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.545701 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0034  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
164 aa  71.6  4e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.156182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.97 
 
 
152 aa  69.3  2e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.27 
 
 
165 aa  68.6  3e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.06 
 
 
159 aa  67.8  6e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.24 
 
 
147 aa  67.8  6e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3505  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.04 
 
 
147 aa  66.6  1e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3634  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.04 
 
 
147 aa  66.6  1e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3737  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.85 
 
 
149 aa  66.2  2e-10  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.129008  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3093  GCN5-related N-acetyltransferase  34.4 
 
 
144 aa  66.2  2e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1155  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.24 
 
 
145 aa  65.5  3e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2383  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.07 
 
 
153 aa  65.5  3e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675937  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.24 
 
 
147 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.24 
 
 
147 aa  65.1  4e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.24 
 
 
147 aa  65.1  4e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.97 
 
 
147 aa  65.1  4e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 
142 aa  65.1  4e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.290046  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.24 
 
 
147 aa  65.1  4e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61880  peptide n-acetyltransferase RimI  35.66 
 
 
150 aa  64.7  5e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355527  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5385  peptide n-acetyltransferase RimI  35.66 
 
 
150 aa  64.3  6e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
150 aa  64.3  7e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588882  normal  0.610129 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.76 
 
 
147 aa  64.3  7e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03190  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.27 
 
 
160 aa  63.9  8e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.41 
 
 
148 aa  63.9  8e-10  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.92 
 
 
153 aa  63.9  8e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0188  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
155 aa  63.9  9e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.76 
 
 
147 aa  63.9  9e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
147 aa  63.9  9e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3290  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
158 aa  63.5  1e-09  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3941  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30 
 
 
158 aa  63.5  1e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.69 
 
 
147 aa  63.2  1e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.69 
 
 
147 aa  63.2  1e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.05 
 
 
162 aa  62.4  2e-09  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.65 
 
 
152 aa  62.4  2e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0189  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.17 
 
 
161 aa  63.2  2e-09  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0014  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.07 
 
 
147 aa  62.4  2e-09  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268172  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3614  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
152 aa  62.4  2e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4570  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.86 
 
 
157 aa  62  3e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
145 aa  62  3e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.5 
 
 
145 aa  62  3e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.46 
 
 
159 aa  62  3e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.21 
 
 
161 aa  62  3e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3325  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.61 
 
 
147 aa  61.6  4e-09  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.81 
 
 
159 aa  61.2  5e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.65 
 
 
149 aa  61.6  5e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.380338  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0938  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.95 
 
 
176 aa  61.2  6e-09  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1843  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  36.59 
 
 
164 aa  61.2  6e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00686227  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0529  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.86 
 
 
133 aa  61.2  6e-09  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333389  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2151  putative acetyltransferase  30 
 
 
155 aa  60.8  7e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.37 
 
 
150 aa  60.8  7e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.17 
 
 
150 aa  60.8  8e-09  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.8 
 
 
162 aa  60.5  8e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1084  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.48 
 
 
191 aa  60.5  9e-09  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0126129  hitchhiker  0.000306087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.97 
 
 
151 aa  60.5  9e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.89 
 
 
152 aa  60.5  9e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3461  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.48 
 
 
187 aa  60.5  1e-08  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0697  acetyltransferase  34.97 
 
 
151 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.97 
 
 
151 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.97 
 
 
151 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.873568  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0958  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.36 
 
 
173 aa  60.1  1e-08  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4775  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  42.71 
 
 
150 aa  59.7  2e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3283  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.48 
 
 
191 aa  59.7  2e-08  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.33549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
157 aa  59.7  2e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.15 
 
 
148 aa  59.3  2e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.79076e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3325  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.48 
 
 
182 aa  59.7  2e-08  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1396  30S ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.94 
 
 
188 aa  59.3  2e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.15 
 
 
148 aa  59.3  2e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.15 
 
 
148 aa  59.3  2e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>