More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0018 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0018  peptidase M22, glycoprotease  100 
 
 
232 aa  451  1e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0268782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0011  peptidase M22, glycoprotease  83.19 
 
 
232 aa  381  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.202985 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0246  peptidase M22, glycoprotease  71.43 
 
 
231 aa  327  1e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0464  peptidase M22, glycoprotease  68.97 
 
 
231 aa  309  3e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819984  normal  0.799621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0042  putative glycoprotease family protein  74.31 
 
 
233 aa  302  3e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5048  normal  0.440262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0586  peptidase M22, glycoprotease  70.56 
 
 
230 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0456  peptidase M22 glycoprotease  68.83 
 
 
231 aa  291  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1822  peptidase M22 glycoprotease  56.42 
 
 
227 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309714  normal  0.168766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3199  peptidase M22 glycoprotease  51.38 
 
 
226 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150243  normal  0.772653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3523  peptidase M22 glycoprotease  50.22 
 
 
226 aa  182  5e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.256611  normal  0.0963127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2899  peptidase M22 glycoprotease  47.88 
 
 
234 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.328536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3395  peptidase M22 glycoprotease  49.08 
 
 
226 aa  174  1e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4430  peptidase M22 glycoprotease  48.43 
 
 
232 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0939599  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1052  peptidase M22 glycoprotease  47.71 
 
 
259 aa  164  1e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.310661  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3393  peptidase M22 glycoprotease  48.47 
 
 
231 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.265135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0643  peptidase M22 glycoprotease  49.32 
 
 
224 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.732049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0035  peptidase M22 glycoprotease  40.27 
 
 
220 aa  152  6e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0023  peptidase M22 glycoprotease  43.12 
 
 
220 aa  148  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.579068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0037  peptidase M22 glycoprotease  44.29 
 
 
218 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  1.50711e-06 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0432  hypothetical protein  40.99 
 
 
229 aa  138  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0331052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2063  putative protease  39.29 
 
 
261 aa  132  4e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.273267  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2150  protease, putative  39.29 
 
 
261 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  37.95 
 
 
229 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3916  peptidase M22, glycoprotease  40.64 
 
 
225 aa  121  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0015  peptidase M22 glycoprotease  43.89 
 
 
213 aa  114  1e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00456768  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3092  peptidase M22, glycoprotease  37.16 
 
 
215 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3613  peptidase M22 glycoprotease  42.6 
 
 
230 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  41.27 
 
 
237 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  36.63 
 
 
231 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1241  glycoprotease family protein  33.48 
 
 
235 aa  99  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4215  peptidase M22, glycoprotease  37 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.596707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3763  peptidase M22, glycoprotease  48.04 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1112  peptidase M22 glycoprotease  36.56 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  39.13 
 
 
234 aa  95.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1507  hypothetical protein  35.4 
 
 
224 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  32.63 
 
 
231 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  32.63 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  32.63 
 
 
231 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  32.63 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  32.63 
 
 
231 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  32.63 
 
 
231 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  32.63 
 
 
231 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3357  peptidase M22, glycoprotease  34.8 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756151  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4110  peptidase M22 glycoprotease  34.8 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  32.11 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  32.63 
 
 
231 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  32.63 
 
 
231 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  31.58 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  31.58 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  37.8 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  31.58 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  2.8735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  41.35 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1320  peptidase M22, glycoprotease  41.27 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928754 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  34.72 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  38.85 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  35.88 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  41.27 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  35.88 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  35.88 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  37.91 
 
 
236 aa  88.6  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  32.6 
 
 
233 aa  88.6  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16710  hypothetical protein  37.8 
 
 
226 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016316  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  36.91 
 
 
236 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  37.12 
 
 
235 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  37.3 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  36.8 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  29.36 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  31.98 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4043  peptidase M22 glycoprotease  36.99 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  35.03 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  37.5 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  38.89 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  38.1 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  30.17 
 
 
236 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  37.32 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  37.32 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  37.32 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  34.65 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  37.32 
 
 
237 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  36.91 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  38.76 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  36.81 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1146  peptidase M22 glycoprotease  34.67 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  32.65 
 
 
233 aa  85.5  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1453  hypothetical protein  38.1 
 
 
226 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  35.53 
 
 
238 aa  84.7  1e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1071  peptidase M22, glycoprotease  31.86 
 
 
224 aa  85.1  1e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106079  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  34.44 
 
 
234 aa  84.3  1e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0675  peptidase M22 glycoprotease  35.83 
 
 
241 aa  84.7  1e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.892215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  37.6 
 
 
233 aa  83.6  2e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0863  peptidase M22, glycoprotease  41.41 
 
 
215 aa  84  2e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  37.41 
 
 
228 aa  84  2e-15  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  31.72 
 
 
238 aa  84  2e-15  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2105  peptidase M22 glycoprotease  30.52 
 
 
239 aa  84  2e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.949739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  37.6 
 
 
233 aa  83.2  3e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  24.89 
 
 
229 aa  83.2  3e-15  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0540  peptidase M22, glycoprotease  30.09 
 
 
230 aa  83.2  3e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714565  unclonable  1.26844e-09 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  34.51 
 
 
233 aa  83.2  3e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 
233 aa  83.2  3e-15  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  36.65 
 
 
241 aa  83.6  3e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>