32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0007 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  505  1e-142  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  64.66 
 
 
249 aa  308  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  36.29 
 
 
231 aa  173  3e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  38.98 
 
 
247 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  39.92 
 
 
247 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  35.74 
 
 
231 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  34.89 
 
 
231 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  34.89 
 
 
231 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  34.89 
 
 
231 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  40.08 
 
 
245 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  41.2 
 
 
244 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  40.56 
 
 
243 aa  152  6e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  40.16 
 
 
245 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  33.76 
 
 
237 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  37.81 
 
 
544 aa  139  4e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  34.03 
 
 
230 aa  139  5e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  35.29 
 
 
236 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  37.5 
 
 
246 aa  135  7e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  33.87 
 
 
239 aa  132  4e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  34.45 
 
 
232 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  33.48 
 
 
230 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  31.85 
 
 
239 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  30.67 
 
 
237 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5398  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  26.94 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  27.02 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  25.7 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 
269 aa  64.7  1e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  24.2 
 
 
338 aa  52.8  5e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2362  hypothetical protein  25.63 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  27.98 
 
 
400 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02160  hypothetical protein  24.37 
 
 
286 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>