100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0005 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  739  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  63.16 
 
 
380 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0368  hypothetical protein  58.99 
 
 
378 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0565  hypothetical protein  61.28 
 
 
370 aa  355  8e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0145  hypothetical protein  61.43 
 
 
371 aa  352  9e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0706  hypothetical protein  60.98 
 
 
373 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  40.91 
 
 
361 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  42.94 
 
 
363 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2601  hypothetical protein  38.32 
 
 
371 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220305  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  33.96 
 
 
376 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0309  hypothetical protein  31.04 
 
 
363 aa  99.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.631914  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  26.63 
 
 
347 aa  80.1  6e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  33.13 
 
 
360 aa  74.3  3e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  25.55 
 
 
395 aa  73.2  7e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0054  hypothetical protein  24.4 
 
 
338 aa  70.5  5e-11  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0164  hypothetical protein  32.88 
 
 
359 aa  68.9  1e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  30.19 
 
 
238 aa  57.8  3e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  32.89 
 
 
189 aa  57  5e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  31.08 
 
 
350 aa  56.2  9e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.52 
 
 
724 aa  53.5  6e-06  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3993  hypothetical protein  28.95 
 
 
356 aa  51.6  2e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0182739  normal  0.26526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4804  membrane protein-like protein  31.76 
 
 
352 aa  51.6  2e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1427  hypothetical protein  24.73 
 
 
328 aa  51.2  3e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.53 
 
 
746 aa  50.8  4e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1292  fusaric acid resistance protein region  26.99 
 
 
681 aa  50.4  5e-05  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.944306 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  29.17 
 
 
189 aa  49.7  8e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  32.3 
 
 
679 aa  49.7  8e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.18 
 
 
679 aa  49.7  9e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  28.49 
 
 
727 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  31.03 
 
 
188 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  31.43 
 
 
269 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  31.43 
 
 
272 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.49 
 
 
719 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  30.34 
 
 
188 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  27.88 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  30.34 
 
 
188 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  31.03 
 
 
217 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  27.4 
 
 
727 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.73 
 
 
677 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.4 
 
 
727 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  32.86 
 
 
149 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1421  hypothetical membrane spanning protein  21.1 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.230954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  28.67 
 
 
189 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1484  hypothetical protein  21.1 
 
 
377 aa  47.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.356024  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.58 
 
 
704 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4189  hypothetical protein  30.73 
 
 
487 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154141 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  31.03 
 
 
197 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  31.03 
 
 
197 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  31.03 
 
 
197 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  31.03 
 
 
197 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  31.03 
 
 
197 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  31.86 
 
 
679 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  29.94 
 
 
676 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  28.41 
 
 
724 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  30.87 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  29.29 
 
 
188 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  30.87 
 
 
217 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2060  fusaric acid resistance protein region  44.29 
 
 
635 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.065197  normal  0.166692 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.64 
 
 
733 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  29.29 
 
 
188 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  30.37 
 
 
600 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  24.89 
 
 
720 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  21.95 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  28.16 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  28.16 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  30.57 
 
 
695 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  28.16 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.16 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  28.76 
 
 
700 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  28.16 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  28.16 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  28.16 
 
 
733 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1977  hypothetical protein  23.38 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  27.84 
 
 
724 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.82 
 
 
653 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1943  membrane protein-like protein  23.38 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  27.49 
 
 
733 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  25.27 
 
 
702 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4422  fusaric acid resistance protein region  27.31 
 
 
690 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.54 
 
 
679 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  29.94 
 
 
718 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0176  fusaric acid resistance protein region  29.49 
 
 
695 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5051  fusaric acid resistance protein region  29.94 
 
 
695 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4282  fusaric acid resistance protein region  27.31 
 
 
711 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4234  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.31 
 
 
690 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  29.94 
 
 
695 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  27.54 
 
 
673 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  27.54 
 
 
673 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  27.54 
 
 
673 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  27.7 
 
 
734 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1402  hypothetical protein  25.73 
 
 
364 aa  43.1  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0118  fusaric acid resistance protein region  27.31 
 
 
690 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.429698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  27.7 
 
 
734 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  26.6 
 
 
680 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1652  Fusaric acid resistance protein conserved region  32 
 
 
653 aa  42.7  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421943  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  27.7 
 
 
734 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1611  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.36 
 
 
679 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.461133  normal  0.751418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1733  fusaric acid resistance domain protein  27.36 
 
 
679 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105287  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.1 
 
 
700 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  28.57 
 
 
638 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.121215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>