More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5512 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  59.31 
 
 
577 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5512  NAD+ synthetase  100 
 
 
583 aa  1171    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362156  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  64.35 
 
 
590 aa  736    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  58.14 
 
 
591 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.13 
 
 
597 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  55.44 
 
 
584 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  53.6 
 
 
601 aa  581  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  54.76 
 
 
591 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3146  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  52.81 
 
 
606 aa  558  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.814025  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  51.28 
 
 
598 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  53.15 
 
 
599 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  52.4 
 
 
571 aa  555  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  52.46 
 
 
577 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  51.28 
 
 
586 aa  543  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  48.72 
 
 
553 aa  494  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4955  NAD+ synthetase  49.66 
 
 
586 aa  495  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  47.24 
 
 
611 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  45.85 
 
 
582 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0887  NAD+ synthetase  44.26 
 
 
570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1488  NAD+ synthetase  47.26 
 
 
553 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1848  NAD+ synthetase  47.61 
 
 
547 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0695  putative amidohydrolase  43.59 
 
 
565 aa  419  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.8 
 
 
566 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  39.29 
 
 
566 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  36.18 
 
 
573 aa  389  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  38.95 
 
 
566 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  37.23 
 
 
583 aa  382  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.11 
 
 
577 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  38.33 
 
 
552 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  40.65 
 
 
561 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  34.11 
 
 
575 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  41.06 
 
 
556 aa  368  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  39.93 
 
 
546 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.86 
 
 
543 aa  363  7.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  36.71 
 
 
567 aa  362  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  41.05 
 
 
554 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  40.44 
 
 
587 aa  360  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  36.88 
 
 
567 aa  360  4e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0807  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40 
 
 
537 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.148145  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1165  NAD+ synthetase  38.98 
 
 
539 aa  358  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.841615  normal  0.341273 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  39.56 
 
 
540 aa  359  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  38.71 
 
 
545 aa  356  6.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  37.23 
 
 
542 aa  356  7.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  38.47 
 
 
564 aa  356  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  37.48 
 
 
576 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0684  NAD+ synthetase  38.47 
 
 
539 aa  353  5.9999999999999994e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.434456  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  41.2 
 
 
571 aa  352  8e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  42.01 
 
 
539 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  36.81 
 
 
576 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  37.18 
 
 
542 aa  352  1e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1103  NAD+ synthetase  38.18 
 
 
554 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0609697  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  37.82 
 
 
565 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.97 
 
 
535 aa  349  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  38.11 
 
 
552 aa  349  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  36.56 
 
 
545 aa  348  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  40.03 
 
 
554 aa  348  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  38.67 
 
 
541 aa  346  7e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  39.59 
 
 
554 aa  345  1e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  37.39 
 
 
540 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  37.46 
 
 
538 aa  343  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  38.23 
 
 
540 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  38.23 
 
 
540 aa  340  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  38.23 
 
 
540 aa  340  4e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2199  NAD synthetase  38.76 
 
 
587 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1117  NAD synthetase  39.03 
 
 
566 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2082  NAD synthetase  37.31 
 
 
587 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685208  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1485  NAD synthetase  37.31 
 
 
583 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.462256  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  39.49 
 
 
550 aa  337  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  36.24 
 
 
561 aa  337  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0800  hypothetical protein  36.3 
 
 
536 aa  336  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  37.78 
 
 
538 aa  336  7.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2347  NAD synthetase  38.42 
 
 
546 aa  336  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.377838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  36.97 
 
 
562 aa  336  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1225  NAD synthetase  37.75 
 
 
583 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410513  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  39.6 
 
 
567 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  35.13 
 
 
566 aa  333  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  39.63 
 
 
566 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  39.63 
 
 
566 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0771  hypothetical protein  35.79 
 
 
536 aa  333  6e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  30.8 
 
 
574 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  40.51 
 
 
549 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  40.51 
 
 
549 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  35.13 
 
 
577 aa  333  7.000000000000001e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3396  NAD synthetase  37.44 
 
 
562 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2416  NAD synthetase  39.57 
 
 
572 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00518413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5739  NAD synthetase  38.74 
 
 
568 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.630816  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2060  NAD synthetase  38.42 
 
 
585 aa  331  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.235816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2457  NAD synthetase  39.24 
 
 
576 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0627806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0878  NAD synthetase  39.09 
 
 
566 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0741  NAD synthetase  39.46 
 
 
566 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.233333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  39.46 
 
 
566 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  39.4 
 
 
609 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2272  NAD synthetase  39.4 
 
 
609 aa  330  6e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  39.46 
 
 
566 aa  330  6e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3381  NAD synthetase  37.75 
 
 
585 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000863364  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0882  NAD synthetase  38.79 
 
 
561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  36.15 
 
 
559 aa  327  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2158  NAD synthetase  38.16 
 
 
545 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.339223  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3346  NAD synthetase  35.35 
 
 
552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  38.16 
 
 
545 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>