More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5477 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  100 
 
 
330 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  64.1 
 
 
324 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  56.95 
 
 
314 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  49.86 
 
 
353 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
323 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  45.48 
 
 
321 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.33 
 
 
310 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  45.36 
 
 
319 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.09 
 
 
347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
309 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  52.86 
 
 
276 aa  209  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
314 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
310 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  41.64 
 
 
308 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  41.83 
 
 
309 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  42.66 
 
 
343 aa  205  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  36.96 
 
 
283 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  41.58 
 
 
309 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  50.48 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  40.4 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  40.4 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  40.2 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
280 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.6 
 
 
304 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  40.79 
 
 
319 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  40.07 
 
 
310 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
313 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  48.86 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  40.38 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.01 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  51.46 
 
 
284 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.2 
 
 
322 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
300 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  40.14 
 
 
388 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  40.39 
 
 
302 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
301 aa  192  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  47.93 
 
 
301 aa  192  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  40.58 
 
 
303 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  39.4 
 
 
308 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  37.58 
 
 
326 aa  190  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  40.78 
 
 
312 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  52.04 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  49.27 
 
 
282 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  48.78 
 
 
290 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.94 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.69 
 
 
301 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
305 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.84 
 
 
310 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  38.49 
 
 
374 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.61 
 
 
310 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  36.42 
 
 
305 aa  186  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
306 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.54 
 
 
308 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.06 
 
 
313 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  37.74 
 
 
305 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 
305 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  39.74 
 
 
330 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  36.42 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  41.56 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  39.87 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  38.44 
 
 
331 aa  184  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.84 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  39.35 
 
 
314 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  39.41 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 
302 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  46.23 
 
 
303 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 
345 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  34.94 
 
 
311 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  41.29 
 
 
299 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 
339 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.3 
 
 
320 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  40.32 
 
 
312 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  37.11 
 
 
339 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  39.82 
 
 
295 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  37.11 
 
 
339 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  45.63 
 
 
314 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.81 
 
 
317 aa  176  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  38.04 
 
 
256 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  41.01 
 
 
253 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.5 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.73 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  38.2 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.41 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  38.82 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  49.76 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.26 
 
 
324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  37.34 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.98 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 
253 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 
253 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  39.35 
 
 
303 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  43.78 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.27 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  43.78 
 
 
253 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  39.52 
 
 
256 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 
253 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>