33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5442 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5442  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5037  putative signal transduction histidine kinase  69.43 
 
 		 173 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.476889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4139  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.86 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1352  hypothetical protein  45.8 
 
 		 145 aa  104  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0391  hypothetical protein  48.04 
 
 		 136 aa  86.3  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1268  hypothetical protein  37.72 
 
 		 172 aa  84  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4807  hypothetical protein  51.92 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.35 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  37.86 
 
 		 158 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 137 aa  47.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.21 
 
 		 155 aa  47.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 134 aa  47.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 132 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  37.84 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  32.85 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  29.68 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0305  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.85 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  31.62 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 142 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 		 207 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0019  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  27.83 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.4 
 
 		 738 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  35.54 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  31.01 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 167 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  34.26 
 
 		 197 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1516  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 		 131 aa  41.6  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.124385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  31.76 
 
 		 855 aa  40.8  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>