More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5375 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  100 
 
 		 402 aa  789    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  54.37 
 
 		 384 aa  343  4e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  56.18 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  50.68 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  51.77 
 
 		 371 aa  329  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  50.68 
 
 		 372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  51.47 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  50.13 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  52.22 
 
 		 388 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  53.89 
 
 		 378 aa  319  6e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  49.74 
 
 		 437 aa  319  6e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  48.49 
 
 		 381 aa  316  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  47.03 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  51.09 
 
 		 376 aa  315  8e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  54.34 
 
 		 380 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  48.67 
 
 		 397 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  50.96 
 
 		 375 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  49.17 
 
 		 366 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  52.47 
 
 		 378 aa  310  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  48.53 
 
 		 374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  46.13 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  46.13 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  46.13 
 
 		 383 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  49.02 
 
 		 410 aa  302  6.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  49.73 
 
 		 383 aa  301  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  46.92 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  49.3 
 
 		 394 aa  297  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  50 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  48.91 
 
 		 378 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  49.61 
 
 		 391 aa  294  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  49.61 
 
 		 415 aa  292  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  48.63 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  43.46 
 
 		 410 aa  288  2e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  48.37 
 
 		 390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  46.98 
 
 		 412 aa  280  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  44.14 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  40.34 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  46.08 
 
 		 441 aa  265  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  46.11 
 
 		 380 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  43.05 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  48.85 
 
 		 401 aa  256  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  36.44 
 
 		 373 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  37.26 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  39.4 
 
 		 377 aa  254  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  37.26 
 
 		 373 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  38.59 
 
 		 389 aa  252  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  34.48 
 
 		 380 aa  248  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  39.1 
 
 		 390 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  38.21 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  34.51 
 
 		 388 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  36.86 
 
 		 391 aa  243  6e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  36.86 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  45.05 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  36.31 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  36.59 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  35.79 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  36.76 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  36.76 
 
 		 391 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  43.77 
 
 		 390 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  35.33 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  36.31 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  38.5 
 
 		 376 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  41.22 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  38.54 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  36.04 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  36.31 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  40.98 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  40.6 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  36.83 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  35.77 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  39.07 
 
 		 371 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  37.57 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  36.59 
 
 		 408 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  38.01 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  36.94 
 
 		 381 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  38.93 
 
 		 375 aa  223  6e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  33.6 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  41.62 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  35.22 
 
 		 386 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  32.8 
 
 		 398 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  38.44 
 
 		 434 aa  219  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  34.95 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  37.5 
 
 		 411 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  38.28 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  34.42 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  37.05 
 
 		 387 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  32.98 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  36.24 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  33.69 
 
 		 379 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  33.98 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  32.52 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  36.63 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  37.23 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  35.97 
 
 		 403 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  29.97 
 
 		 369 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  37.74 
 
 		 380 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  35.28 
 
 		 851 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  37.74 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  36.94 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  39.2 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>