More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5364 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 
545 aa  1047    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.62 
 
 
511 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  51.48 
 
 
488 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  50.65 
 
 
546 aa  428  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  47.08 
 
 
542 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.91 
 
 
525 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.49 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.52 
 
 
520 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.62 
 
 
508 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  44.89 
 
 
531 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  44.58 
 
 
528 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  45.75 
 
 
554 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  51.18 
 
 
531 aa  393  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.3 
 
 
512 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  44.75 
 
 
523 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  45.06 
 
 
534 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.2 
 
 
509 aa  384  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.35 
 
 
521 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.34 
 
 
505 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.25 
 
 
505 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  43.59 
 
 
512 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.59 
 
 
512 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.59 
 
 
512 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  54.37 
 
 
524 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  46.35 
 
 
538 aa  360  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.02 
 
 
515 aa  352  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  44.38 
 
 
570 aa  348  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  53.92 
 
 
608 aa  340  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.59 
 
 
508 aa  332  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.72 
 
 
532 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.2 
 
 
552 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  49.03 
 
 
501 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  42.91 
 
 
501 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.64 
 
 
465 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  37.93 
 
 
528 aa  181  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  31.69 
 
 
489 aa  176  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.6 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  33.15 
 
 
505 aa  163  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.81 
 
 
405 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.81 
 
 
405 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.41 
 
 
402 aa  120  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  32.06 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  32.23 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  32.28 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.79 
 
 
401 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  31.46 
 
 
401 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.89 
 
 
376 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  30.96 
 
 
406 aa  114  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.45 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.22 
 
 
403 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  28.66 
 
 
402 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.74 
 
 
400 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.31 
 
 
426 aa  104  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.58 
 
 
370 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.44 
 
 
416 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.59 
 
 
402 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.77 
 
 
415 aa  100  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.64 
 
 
407 aa  99.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  27.95 
 
 
369 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  27.44 
 
 
412 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  27.42 
 
 
431 aa  98.6  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.24 
 
 
363 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  31.85 
 
 
414 aa  96.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  28.72 
 
 
410 aa  96.7  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.6 
 
 
415 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  29.54 
 
 
409 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.34 
 
 
453 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.79 
 
 
408 aa  95.9  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.58 
 
 
414 aa  95.1  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  26.38 
 
 
414 aa  94.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.26 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.53 
 
 
417 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  28.16 
 
 
461 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  28.16 
 
 
461 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  27.71 
 
 
407 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  26.27 
 
 
369 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  28.11 
 
 
229 aa  90.5  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  29.47 
 
 
437 aa  90.9  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  26.58 
 
 
409 aa  90.1  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0813  sulfite:cytochrome C oxidoreductase subunit A  29.32 
 
 
379 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  26.93 
 
 
405 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  32.16 
 
 
270 aa  89.4  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.25 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  28.82 
 
 
361 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.94 
 
 
406 aa  89.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30 
 
 
199 aa  88.2  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.1 
 
 
200 aa  87.8  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  26.3 
 
 
451 aa  88.2  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  27.24 
 
 
369 aa  87.8  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.1 
 
 
335 aa  87.8  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 
406 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 
402 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.44 
 
 
207 aa  85.5  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.38 
 
 
209 aa  85.9  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  28.34 
 
 
446 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  28.61 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  25.74 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  29.07 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  28.42 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  28.42 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>