More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5333 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  100 
 
 
494 aa  974    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  57.81 
 
 
311 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  58.09 
 
 
308 aa  342  9e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  57.86 
 
 
301 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  58.19 
 
 
307 aa  329  9e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  57.48 
 
 
349 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  57.58 
 
 
304 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  58.72 
 
 
308 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  50.67 
 
 
299 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  56.48 
 
 
305 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  48.36 
 
 
308 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  48.03 
 
 
307 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  52.15 
 
 
308 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 
310 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 
310 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  48.36 
 
 
313 aa  253  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  49.84 
 
 
309 aa  243  7.999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  49.19 
 
 
298 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  46.23 
 
 
319 aa  230  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  46.54 
 
 
319 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  45.36 
 
 
311 aa  226  9e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 
310 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  45.71 
 
 
317 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  45.71 
 
 
317 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  45.4 
 
 
317 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  43.73 
 
 
322 aa  216  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  43.38 
 
 
327 aa  212  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0133  hypothetical protein  73.65 
 
 
165 aa  206  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.732285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  43.35 
 
 
270 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 
310 aa  183  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.13 
 
 
308 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3837  hypothetical protein  54.9 
 
 
159 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0327669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3911  hypothetical protein  54.9 
 
 
159 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3823  hypothetical protein  54.9 
 
 
159 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.40568  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4845  protein of unknown function DUF309  60.74 
 
 
156 aa  153  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03460  protein of unknown function (DUF309)  52.41 
 
 
158 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
303 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5496  protein of unknown function DUF309  59.54 
 
 
185 aa  143  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000612718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0208  hypothetical protein  50.7 
 
 
177 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0206  protein of unknown function DUF309  56.34 
 
 
180 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
287 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5850  hypothetical protein  50.97 
 
 
163 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
286 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 
301 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0473  hypothetical protein  62.07 
 
 
149 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  42.6 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0964  hypothetical protein  54.81 
 
 
158 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.343587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.11 
 
 
270 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  43.27 
 
 
294 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
287 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  34.17 
 
 
322 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 
293 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 
297 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
284 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.43 
 
 
289 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
312 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
305 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  34.04 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1989  hypothetical protein  48.43 
 
 
184 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 
305 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
291 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
291 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 
287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
291 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  39.9 
 
 
304 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  34.28 
 
 
317 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  52.5 
 
 
350 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
288 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
288 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  35.79 
 
 
288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  35.57 
 
 
294 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
328 aa  117  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
287 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  31.21 
 
 
315 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  36.2 
 
 
277 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 
287 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2994  hypothetical protein  54.01 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.415801 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  30.75 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  45.53 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 
341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 
291 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  46.34 
 
 
351 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
315 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
291 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
290 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
288 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  31.66 
 
 
323 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
308 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
292 aa  107  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  28.16 
 
 
334 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  32.07 
 
 
289 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  49.61 
 
 
330 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>