61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5280 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  100 
 
 		 353 aa  727    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  32.81 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  35.38 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  32.86 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  28.85 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  31.79 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  38.19 
 
 		 650 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  28.22 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  30.82 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  31.61 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  28.72 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  31.25 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  32.28 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  27.17 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  26.47 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  29.03 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  30.63 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  24.74 
 
 		 638 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  25.27 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  24.58 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  31.46 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  24.58 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  25.76 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  25.76 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  27.04 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  31.68 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  28 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0746  hypothetical protein  26.77 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  25.44 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  28.87 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  28.4 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  29.93 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  23.3 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  29.37 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  25.87 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  24.47 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  24.52 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  25.13 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  33.76 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  25.27 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  28.74 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  31.82 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  25.27 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2539  protein of unknown function DUF262  24.85 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000210562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  26.74 
 
 		 539 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  40 
 
 		 159 aa  53.1  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  26.61 
 
 		 368 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  27.23 
 
 		 458 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  26.39 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  25.82 
 
 		 617 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1065  hypothetical protein  28.72 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  36 
 
 		 402 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  21.78 
 
 		 390 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  25.14 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  24.88 
 
 		 390 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  35.16 
 
 		 764 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  28.66 
 
 		 555 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  28.06 
 
 		 760 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2207  hypothetical protein  34.31 
 
 		 149 aa  43.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.932565  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  35.62 
 
 		 657 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>