More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5264 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5264  Rhodanese domain protein  100 
 
 
110 aa  223  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3058  rhodanese-like  61.82 
 
 
110 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  60 
 
 
112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0124  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  59.63 
 
 
110 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112087  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0042  rhodanese domain-containing protein  60.58 
 
 
107 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0213  Rhodanese domain protein  54.13 
 
 
109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0074  Rhodanese domain protein  61.62 
 
 
115 aa  120  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0226  Rhodanese domain protein  53.85 
 
 
113 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0166  Rhodanese domain protein  55.24 
 
 
115 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.919693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  49.55 
 
 
111 aa  108  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  50.45 
 
 
111 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  55.34 
 
 
118 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01120  Rhodanese-related sulfurtransferase  49.06 
 
 
108 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0244  Rhodanese domain protein  52.04 
 
 
107 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  45.79 
 
 
108 aa  101  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0281  Rhodanese domain protein  48 
 
 
108 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.161319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  43.97 
 
 
116 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5669  rhodanese domain-containing protein  46.3 
 
 
113 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192192  hitchhiker  0.00438713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25560  Rhodanese-related sulfurtransferase  45.45 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.983275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  48.54 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  52.53 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  51.55 
 
 
111 aa  94.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01150  Rhodanese-related sulfurtransferase  47.52 
 
 
107 aa  92.8  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  46.6 
 
 
116 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  45.63 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  45.63 
 
 
116 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  49.54 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  44.76 
 
 
125 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  55.7 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0131  Rhodanese domain protein  55.13 
 
 
116 aa  83.6  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.189011  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  55.56 
 
 
356 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  53.09 
 
 
356 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  53.09 
 
 
356 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  54.32 
 
 
356 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  44.44 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  54.32 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 
110 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  54.32 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0167  Rhodanese domain protein  50 
 
 
117 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  44.05 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  51.85 
 
 
356 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  43.9 
 
 
113 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4642  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 
109 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.845465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  45.45 
 
 
116 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  47.37 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  44.3 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  41.41 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  41.38 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0162  Rhodanese domain protein  43.9 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.963879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  47.56 
 
 
471 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  46.43 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  45.65 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  43.04 
 
 
98 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  42.31 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  41.84 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  42.5 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  37.33 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  42.57 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  42.86 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  41.77 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  41.77 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.77 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  41.77 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  41.77 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  46.15 
 
 
269 aa  70.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  49.35 
 
 
98 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3004  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.11 
 
 
560 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  43.24 
 
 
98 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  44.05 
 
 
565 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6622  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.44 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  39.77 
 
 
470 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  40.54 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4191  beta-lactamase domain protein  42 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0163085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  42.68 
 
 
103 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  44.59 
 
 
484 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.59 
 
 
478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  34.95 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.59 
 
 
478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  44 
 
 
478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  44.59 
 
 
484 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  44.59 
 
 
478 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  39.29 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.31 
 
 
478 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3752  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.46 
 
 
551 aa  67.8  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  40.54 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2577  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000018103  decreased coverage  0.0000278243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  40.51 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  41.46 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  44.74 
 
 
277 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>