More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5249 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  100 
 
 
469 aa  917    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  52.54 
 
 
460 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  50.86 
 
 
459 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  53.59 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  48.91 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  46.81 
 
 
517 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  48.03 
 
 
517 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  50.11 
 
 
496 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  50.55 
 
 
563 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  50.68 
 
 
533 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  45.89 
 
 
498 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  46.4 
 
 
493 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  48.48 
 
 
481 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  48.28 
 
 
457 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  45.97 
 
 
469 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  46.94 
 
 
463 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  44.82 
 
 
529 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  47.45 
 
 
486 aa  360  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  45.34 
 
 
470 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  47.48 
 
 
470 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  47.48 
 
 
470 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  47.48 
 
 
470 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  47.75 
 
 
462 aa  356  5.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  48.86 
 
 
459 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  42.25 
 
 
659 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  44.68 
 
 
470 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  44.47 
 
 
496 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  48.87 
 
 
474 aa  342  8e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  51.55 
 
 
494 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  44.44 
 
 
543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  43.98 
 
 
487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  41.67 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  47.95 
 
 
473 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  43.97 
 
 
476 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  43.81 
 
 
487 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  46.51 
 
 
493 aa  319  6e-86  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  49.11 
 
 
519 aa  312  1e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  43.33 
 
 
463 aa  311  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  42.89 
 
 
475 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  39.8 
 
 
429 aa  272  9e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  41.61 
 
 
435 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.48 
 
 
924 aa  258  1e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  38.05 
 
 
426 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.55 
 
 
954 aa  239  9e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  38.46 
 
 
921 aa  234  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  38.23 
 
 
933 aa  229  9e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  37.86 
 
 
439 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  38.93 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  35.03 
 
 
472 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  36.08 
 
 
472 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  34.87 
 
 
405 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  35.55 
 
 
480 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  35.59 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  33.84 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  34.88 
 
 
409 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  32.98 
 
 
414 aa  194  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  34.11 
 
 
409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  37.7 
 
 
444 aa  189  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  32.71 
 
 
422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  37.21 
 
 
443 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  34.82 
 
 
443 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  32.55 
 
 
399 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  32.15 
 
 
422 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  36.69 
 
 
367 aa  160  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  33.6 
 
 
371 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  31.31 
 
 
509 aa  146  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  35.5 
 
 
423 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  30.97 
 
 
365 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  31.32 
 
 
511 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  31.32 
 
 
511 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  31.32 
 
 
511 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.55 
 
 
972 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  31.61 
 
 
501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  31.69 
 
 
506 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  32.54 
 
 
365 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2368  cell cycle protein  27.97 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0217329  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2927  cell division protein FtsW  33.84 
 
 
417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2647  cell division protein FtsW  31.19 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  29.67 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  29.64 
 
 
380 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
543 aa  130  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  31.49 
 
 
420 aa  130  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  30.96 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6114  cell division protein FtsW  33.44 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309326  normal  0.0125207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  29.82 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2561  stage V sporulation protein E  33.82 
 
 
363 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.119412  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  29.23 
 
 
367 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  34.41 
 
 
363 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3957  stage V sporulation protein E  34.41 
 
 
363 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3762  stage V sporulation protein E  34.41 
 
 
363 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  34.41 
 
 
363 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  34.41 
 
 
363 aa  127  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  34.41 
 
 
363 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  34.41 
 
 
363 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  33.82 
 
 
363 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  34.12 
 
 
363 aa  126  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3926  stage V sporulation protein E  34.41 
 
 
363 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000164467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3384  cell division protein FtsW  33.23 
 
 
395 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.319796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1020  stage V sporulation protein E  32.63 
 
 
366 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1743  cell division protein FtsW  30 
 
 
386 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0466348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>