More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5200 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  72.64 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  67.16 
 
 		 197 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  62.19 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.19 
 
 		 201 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.7 
 
 		 201 aa  228  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  62.19 
 
 		 201 aa  228  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.4 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.07 
 
 		 204 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.7 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  62 
 
 		 205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  61.19 
 
 		 201 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.2 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.19 
 
 		 204 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  57.43 
 
 		 202 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 201 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.23 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.73 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.22 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.21 
 
 		 200 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.88 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.24 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.5 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  55.72 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  50.99 
 
 		 204 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.97 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.75 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.76 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  49 
 
 		 198 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.26 
 
 		 200 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 190 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.26 
 
 		 200 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 200 aa  178  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  50.75 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.25 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.26 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 200 aa  174  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.5 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.75 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  44.22 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  47.76 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  45.45 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 200 aa  161  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  46.57 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 		 198 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.5 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  46.5 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  48.76 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  46 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.62 
 
 		 144 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  34.85 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  31.34 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 200 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4244  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 206 aa  131  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  34.76 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  37 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  37 
 
 		 196 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>