More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5196 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5196  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 232 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  80.6 
 
 		 232 aa  363  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2914  two component transcriptional regulator  66.37 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2886  response regulator receiver  63.2 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  56.54 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  57.59 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  57.59 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.59 
 
 		 228 aa  227  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.46 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  54.91 
 
 		 230 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  54.82 
 
 		 224 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 		 236 aa  212  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 224 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.23 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  52.61 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  56.47 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  51.57 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  48.66 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  49.11 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 406 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  57.59 
 
 		 228 aa  197  7.999999999999999e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  48.66 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.5 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  58.67 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.52 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  48.66 
 
 		 257 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.96 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.21 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 236 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  54.02 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.46 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.8 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1131  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  49.55 
 
 		 222 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.6 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 		 242 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  48.9 
 
 		 253 aa  187  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  43.23 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  46.43 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  48.03 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.36 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 		 222 aa  185  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  44.93 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  45.78 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.67 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 239 aa  182  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0311  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.280613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  45.73 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2552  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000276879  normal  0.180215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 225 aa  181  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>