More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5158 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  100 
 
 		 149 aa  306  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  83.89 
 
 		 149 aa  271  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  80.95 
 
 		 147 aa  256  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  77.55 
 
 		 147 aa  251  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  78.91 
 
 		 147 aa  249  9.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  74.5 
 
 		 149 aa  235  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  72.79 
 
 		 147 aa  234  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  73.47 
 
 		 147 aa  234  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  73.47 
 
 		 147 aa  234  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  73.47 
 
 		 147 aa  234  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  74.15 
 
 		 147 aa  233  7e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  231  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  75.51 
 
 		 150 aa  230  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  73.47 
 
 		 147 aa  229  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  70.75 
 
 		 147 aa  227  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  226  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  226  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  70.75 
 
 		 147 aa  226  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  225  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  72.11 
 
 		 147 aa  224  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 		 147 aa  222  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  71.43 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0720  50S ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  68.71 
 
 		 147 aa  220  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  69.13 
 
 		 149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 		 147 aa  218  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0889  50S ribosomal protein L13  67.35 
 
 		 147 aa  214  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1176  ribosomal protein L13  65.99 
 
 		 147 aa  209  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.874786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  65.31 
 
 		 147 aa  209  7.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  64.63 
 
 		 147 aa  206  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  63.27 
 
 		 147 aa  205  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  63.51 
 
 		 148 aa  201  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 		 142 aa  200  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  60.54 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  64.75 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 		 144 aa  197  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  61.22 
 
 		 147 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  61.22 
 
 		 147 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  61.22 
 
 		 147 aa  196  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0745  ribosomal protein L13  61.64 
 
 		 146 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 146 aa  195  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 145 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  62.04 
 
 		 148 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  59.31 
 
 		 145 aa  194  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 144 aa  194  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  63.38 
 
 		 154 aa  192  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 146 aa  191  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  59.03 
 
 		 150 aa  191  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  59.85 
 
 		 144 aa  190  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  61.59 
 
 		 148 aa  190  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  60.99 
 
 		 145 aa  189  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  189  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 144 aa  188  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  189  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229053  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0252  ribosomal protein L13  57.05 
 
 		 149 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1693  50S ribosomal protein L13  57.72 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0818735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  62.86 
 
 		 145 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1062  50S ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 144 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000039802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000130449  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  60.84 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000157584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0410  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000575017  normal  0.0346472 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  58.74 
 
 		 149 aa  187  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1233  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2704  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 176 aa  187  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191056  normal  0.974545 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3414  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000814026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0599  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 176 aa  186  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000510805  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  187  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3765  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.413551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3157  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386051 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0196  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0646  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000032865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0573  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000226518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0679  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  186  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000098694  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2836  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3354  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000156516  hitchhiker  0.0000450928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0607  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000615689  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4053  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  185  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0049  ribosomal protein L13  57.75 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  62.04 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5914  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000007734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0500  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>