More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5144 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  77.83 
 
 
442 aa  701  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
437 aa  872  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  66.74 
 
 
438 aa  603  1e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  68.65 
 
 
432 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  68.95 
 
 
435 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  65.3 
 
 
437 aa  589  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  63.55 
 
 
436 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  64.53 
 
 
430 aa  552  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0708  preprotein translocase, SecY subunit  63.93 
 
 
438 aa  548  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  62.73 
 
 
437 aa  549  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  64.16 
 
 
430 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  61 
 
 
441 aa  546  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  61.17 
 
 
436 aa  539  1e-152  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  60.76 
 
 
441 aa  532  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  58.43 
 
 
445 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4295  preprotein translocase subunit SecY  60.76 
 
 
441 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  57.56 
 
 
441 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  59.37 
 
 
441 aa  527  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  57.56 
 
 
441 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  57.56 
 
 
441 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2668  preprotein translocase subunit SecY  60.22 
 
 
436 aa  525  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2956  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 
436 aa  521  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  58.96 
 
 
439 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0951  preprotein translocase, SecY subunit  60.94 
 
 
448 aa  515  1e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.830582  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  59.68 
 
 
435 aa  516  1e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2633  preprotein translocase, SecY subunit  61.42 
 
 
431 aa  514  1e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  57.99 
 
 
429 aa  509  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  58.2 
 
 
445 aa  508  1e-142  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1147  preprotein translocase, SecY subunit  58.48 
 
 
445 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  59.59 
 
 
429 aa  500  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3123  preprotein translocase, SecY subunit  62.13 
 
 
436 aa  495  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1206  preprotein translocase SecY subunit  57.61 
 
 
457 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533641  normal  0.0165275 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  56.11 
 
 
439 aa  493  1e-138  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0647  preprotein translocase, SecY subunit  58.68 
 
 
432 aa  494  1e-138  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23600  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  55.94 
 
 
434 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16970  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  55.45 
 
 
435 aa  480  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0174147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1053  preprotein translocase, SecY subunit  57.08 
 
 
449 aa  480  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.615544 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3954  preprotein translocase, SecY subunit  51.47 
 
 
434 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0271  preprotein translocase, SecY subunit  50.46 
 
 
447 aa  424  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1727  preprotein translocase subunit SecY  49.54 
 
 
445 aa  423  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  4.16171e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0418  preprotein translocase, SecY subunit  47.95 
 
 
431 aa  392  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  47.18 
 
 
421 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  47.83 
 
 
423 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  48.06 
 
 
445 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  47.24 
 
 
447 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  46.12 
 
 
428 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  46.7 
 
 
429 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  47.24 
 
 
447 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  45.82 
 
 
420 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  46.52 
 
 
421 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09800  preprotein translocase, SecY subunit  46.76 
 
 
427 aa  381  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.141788  hitchhiker  3.95879e-05 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  46.77 
 
 
447 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  46.55 
 
 
435 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  46.74 
 
 
419 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  45.29 
 
 
437 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  47.61 
 
 
429 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  46.21 
 
 
426 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  45.37 
 
 
418 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  47.25 
 
 
424 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  46.53 
 
 
448 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  42.99 
 
 
443 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  43.4 
 
 
430 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  45.07 
 
 
435 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  44.91 
 
 
449 aa  362  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  45.85 
 
 
445 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  44.62 
 
 
435 aa  362  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  8.11889e-07 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  44.84 
 
 
435 aa  362  8e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02472e-07 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  44.14 
 
 
435 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 
435 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  43.21 
 
 
419 aa  360  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.11 
 
 
463 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  46.08 
 
 
419 aa  359  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  45.18 
 
 
443 aa  358  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  43.42 
 
 
438 aa  358  1e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  44.57 
 
 
446 aa  358  1e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  44.54 
 
 
430 aa  357  2e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  46.33 
 
 
437 aa  357  3e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  46.19 
 
 
442 aa  356  4e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  44.55 
 
 
444 aa  356  4e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  45.16 
 
 
445 aa  356  5e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 
437 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  43.31 
 
 
435 aa  355  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.16119e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  41.42 
 
 
443 aa  355  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  45.73 
 
 
444 aa  353  3e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  4.20552e-06 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.93 
 
 
427 aa  352  6e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  44.57 
 
 
419 aa  352  9e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  43.65 
 
 
446 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  44.11 
 
 
446 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  43.49 
 
 
448 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  45.79 
 
 
442 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.52006e-07  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  45.27 
 
 
446 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  44.04 
 
 
441 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  7.25785e-06  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  43.91 
 
 
443 aa  350  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  44.01 
 
 
435 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  43.42 
 
 
446 aa  349  7e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0305  preprotein translocase subunit SecY  43.32 
 
 
453 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.398461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  45.6 
 
 
443 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  45.6 
 
 
443 aa  349  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  2.66535e-11 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1141  preprotein translocase, SecY subunit  44.6 
 
 
426 aa  348  8e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  4.40606e-06  normal  0.0147779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  42.83 
 
 
435 aa  348  9e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>