More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5135 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5135  ribosomal protein L24  100 
 
 		 101 aa  197  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.403421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2635  50S ribosomal protein L24  83.17 
 
 		 101 aa  170  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.253933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4310  ribosomal protein L24  71.29 
 
 		 100 aa  142  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.43322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  63.46 
 
 		 104 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  59.62 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  57.69 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 104 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3712  ribosomal protein L24  60 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  52.38 
 
 		 108 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1134  ribosomal protein L24  56.73 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4496  ribosomal protein L24  55.77 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2054  50S ribosomal protein L24  54.37 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00180393  normal  0.0527176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1026  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0000241129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  59.6 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1043  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000412031  normal  0.190352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1055  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 		 105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00246743  normal  0.25202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10729  50S ribosomal protein L24  55.24 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  51.96 
 
 		 105 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  57.28 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  104  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  52.53 
 
 		 105 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1196  50S ribosomal protein L24  52.88 
 
 		 104 aa  103  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 102 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0090  50S ribosomal protein L24  48.54 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0661954 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2246  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 107 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00124934  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0432  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0323669  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  58 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  51.52 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4265  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 		 105 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000655615  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06360  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 104 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3898  50S ribosomal protein L24  53.92 
 
 		 104 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00126984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  48.48 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  52.43 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2313  50S ribosomal protein L24  56.99 
 
 		 105 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.103377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  47.47 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3894  50S ribosomal protein L24  50 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  55 
 
 		 104 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  48.48 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 		 105 aa  97.1  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  53.4 
 
 		 105 aa  97.4  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  46.53 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 104 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1333  50S ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000196536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  50.98 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  46.6 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  45.63 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  54 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5036  50S ribosomal protein L24  50.48 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000829626  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0169  50S ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000484148  hitchhiker  0.000323291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0726  ribosomal protein L24  50.49 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2763  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0195  50S ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000100309  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4306  50S ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000126624  unclonable  0.0000000000482395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0159  50S ribosomal protein L24  55.21 
 
 		 104 aa  94.4  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000158735  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0847  50S ribosomal protein L24  53.41 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0242  50S ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0970  50S ribosomal protein L24  49.02 
 
 		 105 aa  93.6  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000143141  hitchhiker  0.000000947265 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0210  50S ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216375  unclonable  0.0000000000129617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0205  50S ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0210  50S ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 104 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745945  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  47.57 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0730  ribosomal protein L24  53.06 
 
 		 106 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00351151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0181  50S ribosomal protein L24  52.94 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000129578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4045  50S ribosomal protein L24  56.25 
 
 		 104 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000115284  unclonable  0.00000000000347385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>