More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5129 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5129  ribosomal protein L22  100 
 
 		 122 aa  240  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2641  50S ribosomal protein L22P  88 
 
 		 125 aa  208  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.440118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4316  ribosomal protein L22  77.87 
 
 		 125 aa  184  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  78.18 
 
 		 117 aa  170  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0567  50S ribosomal protein L22  77.57 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  72.97 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  73.08 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  76.92 
 
 		 136 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  69.9 
 
 		 136 aa  147  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  66.99 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  66.99 
 
 		 152 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6044  50S ribosomal protein L22  60.8 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.797605  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  66.98 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  66.67 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  60.75 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  59.5 
 
 		 125 aa  137  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  66.38 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  66.98 
 
 		 142 aa  136  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  62.61 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  57.02 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  65.22 
 
 		 123 aa  133  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  133  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  61.82 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  60.18 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  65.49 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  60.91 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  59.09 
 
 		 113 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  58.27 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  59.09 
 
 		 113 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  63.48 
 
 		 121 aa  130  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  62.39 
 
 		 281 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  61.47 
 
 		 110 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  61.47 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  59.29 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  55.96 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  60.75 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  58.18 
 
 		 112 aa  126  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  58.41 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  58.18 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  55.66 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  50.91 
 
 		 113 aa  123  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  55.17 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0587  50S ribosomal protein L22  61.9 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5044  50S ribosomal protein L22  65.09 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.262839 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  59.09 
 
 		 120 aa  120  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 113 aa  120  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1862  50S ribosomal protein L22  56.25 
 
 		 139 aa  120  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0322744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10720  50S ribosomal protein L22  58.47 
 
 		 197 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91611  normal  0.21333 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09950  LSU ribosomal protein L22P  56.64 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250914  hitchhiker  0.000000894233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1478  50S ribosomal protein L22  57.94 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  53.64 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  55.24 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2908  50S ribosomal protein L22  54.63 
 
 		 125 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  55.45 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  53.21 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  116  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  54.29 
 
 		 119 aa  117  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0153  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  116  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202891  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0175  50S ribosomal protein L22  57.27 
 
 		 110 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2709  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2394  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1310  50S ribosomal protein L22  63.21 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.884294  normal  0.105053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  55.05 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  50.94 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0936  ribosomal protein L22  56.9 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  53.98 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0236  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4312  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000184145  unclonable  0.0000000000444445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4165  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708825  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  51.4 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4685  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000490323  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  51.82 
 
 		 113 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0189  50S ribosomal protein L22  55.45 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000913672  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3754  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000037277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0205  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000176221  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0201  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000591248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0204  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000274538  unclonable  0.0000000000170547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0199  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0119828  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4051  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000608091  unclonable  0.00000000000572517 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0204  50S ribosomal protein L22  56.36 
 
 		 110 aa  114  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000013887  hitchhiker  0.0000000012298 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  54.55 
 
 		 110 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>