More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5124 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5124  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  87.96 
 
 		 216 aa  393  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  80.95 
 
 		 217 aa  363  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  79.05 
 
 		 218 aa  354  5.999999999999999e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  75.47 
 
 		 216 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  71.09 
 
 		 222 aa  318  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0931  ribosomal protein L3  70.95 
 
 		 215 aa  313  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4507  50S ribosomal protein L3  70.81 
 
 		 221 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787031  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1185  50S ribosomal protein L3  71.9 
 
 		 220 aa  305  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6614  ribosomal protein L3  67.29 
 
 		 216 aa  301  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1123  ribosomal protein L3  66.82 
 
 		 220 aa  298  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  65.26 
 
 		 235 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4315  50S ribosomal protein L3  68.6 
 
 		 219 aa  296  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  64.68 
 
 		 219 aa  295  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3923  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 		 219 aa  295  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29740  LSU ribosomal protein L3P  64.68 
 
 		 219 aa  293  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6049  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 236 aa  292  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.185718  normal  0.220559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0627  ribosomal protein L3  64.93 
 
 		 217 aa  292  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  66.06 
 
 		 219 aa  291  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  66.35 
 
 		 219 aa  291  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  67.79 
 
 		 226 aa  291  6e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  63.85 
 
 		 216 aa  291  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  64.45 
 
 		 219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2687  50S ribosomal protein L3  62.91 
 
 		 216 aa  287  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.740328 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  67.62 
 
 		 218 aa  287  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  64.95 
 
 		 218 aa  286  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  62.74 
 
 		 216 aa  287  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  68.1 
 
 		 217 aa  286  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03980  LSU ribosomal protein L3P  65.55 
 
 		 213 aa  285  5e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0688  ribosomal protein L3  63.85 
 
 		 219 aa  284  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3143  ribosomal protein L3  64.9 
 
 		 220 aa  282  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  65.24 
 
 		 217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  63.81 
 
 		 223 aa  281  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  65.4 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  56.25 
 
 		 213 aa  249  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  54.5 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  56.4 
 
 		 212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  53.59 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  53.43 
 
 		 209 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 209 aa  217  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  51.94 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 209 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  52.17 
 
 		 214 aa  214  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  51.9 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0715  ribosomal protein L3  51.94 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  51.46 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  51.21 
 
 		 210 aa  210  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  52.76 
 
 		 211 aa  209  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 		 210 aa  208  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0458  50S ribosomal protein L3P  51.94 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.310193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0398  ribosomal protein L3  46.67 
 
 		 213 aa  204  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 214 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  50.25 
 
 		 208 aa  203  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  50.98 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 212 aa  203  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  50 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  50.72 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 213 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 212 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20031  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 218 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0249  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 212 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.587373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0252  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 		 212 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1129  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  47.87 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  47.34 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  49.05 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  46.86 
 
 		 209 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  47.96 
 
 		 227 aa  198  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 211 aa  198  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  50.23 
 
 		 215 aa  198  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  50.72 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 		 212 aa  197  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  47.29 
 
 		 205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1650  50S ribosomal protein L3  47.03 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  50 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  49.51 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  48.08 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  50.24 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16781  50S ribosomal protein L3  48.04 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  50.49 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  48.54 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  51.43 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>