More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5074 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  900    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  46.54 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2680  extracellular solute-binding protein family 1  38.55 
 
 		 458 aa  302  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  29.83 
 
 		 404 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 415 aa  103  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0496  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  27.05 
 
 		 421 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 414 aa  97.8  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 459 aa  95.9  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  29.51 
 
 		 443 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.52 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.05 
 
 		 438 aa  90.1  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 461 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.57 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.4 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.4 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.26 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  31.3 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.63 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  21.3 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.67 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.79 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  22 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 419 aa  81.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  30.11 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  25.13 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.16 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.69 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1604  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  22.38 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.38 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.25 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  22.72 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0186  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.88 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.62 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0358  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1118  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 400 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  23.2 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.52 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>