232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4983 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  100 
 
 
260 aa  519  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2882  pantothenate kinase  82.17 
 
 
258 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  74.23 
 
 
262 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9156  pantothenate kinase  70.54 
 
 
260 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.166595  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  68.99 
 
 
260 aa  373  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  66.02 
 
 
262 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  59.07 
 
 
256 aa  316  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0464  pantothenate kinase  61.63 
 
 
257 aa  306  2e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  57.53 
 
 
250 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  57.36 
 
 
261 aa  291  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  56.2 
 
 
253 aa  288  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0081  putative transcriptional acitvator, Baf family  50.78 
 
 
255 aa  282  4e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4713  Baf family transcriptional activator  54.44 
 
 
252 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.073438  hitchhiker  0.000383315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4278  Baf family transcriptional activator  54.44 
 
 
254 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  52.33 
 
 
264 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  3.62636e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35530  pantothenate kinase  55.64 
 
 
268 aa  271  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0754114  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0146  pantothenate kinase  53.1 
 
 
254 aa  266  3e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  49.61 
 
 
256 aa  265  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  4.11745e-08  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  49.61 
 
 
254 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0109  Baf family transcriptional regulator  48.08 
 
 
255 aa  254  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00933818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  50 
 
 
258 aa  251  7e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.44798e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  46.51 
 
 
255 aa  249  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00680  pantothenate kinase  46.9 
 
 
257 aa  248  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0065  pantothenate kinase  46.33 
 
 
258 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.07258e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0544  pantothenate kinase  45.14 
 
 
262 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  46.9 
 
 
269 aa  244  1e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2186  Baf family transcriptional activator  49.42 
 
 
255 aa  243  2e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2784  pantothenate kinase  43.24 
 
 
259 aa  243  2e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2470  pantothenate kinase  43.24 
 
 
259 aa  243  2e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  46.9 
 
 
255 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0061  pantothenate kinase  44.57 
 
 
262 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  44.19 
 
 
262 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  44.19 
 
 
262 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  44.19 
 
 
262 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0063  pantothenate kinase  45.74 
 
 
258 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  44.19 
 
 
262 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  44.19 
 
 
262 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  44.19 
 
 
262 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  44.19 
 
 
262 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0074  pantothenate kinase  44.19 
 
 
262 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.335209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4005  transcriptional activator, Baf family  50.38 
 
 
266 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  44.19 
 
 
262 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0126  Baf family transcriptional activator  50.39 
 
 
262 aa  239  3e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.4908e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0801  pantothenate kinase  45.74 
 
 
255 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1296  Baf family transcriptional activator  48.65 
 
 
255 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  44.23 
 
 
262 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  46.51 
 
 
254 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  47.67 
 
 
256 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.16191e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  46.9 
 
 
255 aa  234  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  44.02 
 
 
255 aa  234  1e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.7573e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  45.95 
 
 
258 aa  233  2e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5362  pantothenate kinase  48.29 
 
 
271 aa  231  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331999  normal  0.0497904 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  45.14 
 
 
263 aa  230  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  8.81986e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1868  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.51 
 
 
254 aa  228  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0248735  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4446  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.9 
 
 
261 aa  228  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  45.74 
 
 
254 aa  228  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  43.41 
 
 
254 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  47.29 
 
 
254 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1265  putative transcriptional acitvator, Baf family  47.67 
 
 
262 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  45.35 
 
 
254 aa  225  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1426  pantothenate kinase  48.67 
 
 
270 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  46.56 
 
 
255 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.9 
 
 
254 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4846  pantothenate kinase  47.91 
 
 
267 aa  222  5e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13632  pantothenate kinase  47.17 
 
 
272 aa  222  5e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.3574e-61  normal  0.0267284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4760  pantothenate kinase  47.91 
 
 
267 aa  222  5e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5146  pantothenate kinase  47.91 
 
 
267 aa  222  5e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.64 
 
 
254 aa  221  9e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  45.15 
 
 
274 aa  221  1e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0569  putative transcriptional acitvator, Baf family  45.96 
 
 
285 aa  220  2e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0428  pantothenate kinase  42.02 
 
 
258 aa  218  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.88548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  45.74 
 
 
254 aa  218  8e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1480  pantothenate kinase  48.06 
 
 
254 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0377381  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  45.74 
 
 
254 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  45.74 
 
 
254 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0625  putative transcriptional acitvator, Baf family  41.6 
 
 
263 aa  216  3e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  42.41 
 
 
263 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  7.47608e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3611  Baf family transcriptional activator  41.6 
 
 
264 aa  212  5e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0636  putative transcriptional acitvator, Baf family  46.84 
 
 
273 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  43.46 
 
 
257 aa  197  1e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1477  pantothenate kinase  40.7 
 
 
255 aa  196  5e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148615  normal  0.127378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0936  pantothenate kinase  43.02 
 
 
266 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1370  pantothenate kinase  40.08 
 
 
259 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.682147  normal  0.0338763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  44.71 
 
 
255 aa  194  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1907  putative transcriptional acitvator, Baf family  45.15 
 
 
270 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1220  putative transcriptional acitvator, Baf family  39.46 
 
 
255 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0424  Baf family transcriptional activator  37.6 
 
 
255 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00396752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  41.7 
 
 
257 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  41.7 
 
 
257 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0762  pantothenate kinase  41.09 
 
 
260 aa  181  9e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1989  pantothenate kinase  42.08 
 
 
257 aa  181  9e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.755587 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  40.7 
 
 
253 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  39.23 
 
 
261 aa  179  3e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  40 
 
 
260 aa  177  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  39.54 
 
 
264 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2865  putative transcriptional acitvator, Baf family  42.69 
 
 
260 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  39.38 
 
 
260 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  38.61 
 
 
256 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  38.61 
 
 
256 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  39.77 
 
 
259 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.8886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>