More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4970 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.23 
 
 
759 aa  649    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.33 
 
 
760 aa  746    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.05 
 
 
798 aa  759    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.96 
 
 
671 aa  784    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.32 
 
 
794 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.2 
 
 
671 aa  806    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.99 
 
 
659 aa  806    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  76.68 
 
 
682 aa  1022    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.52 
 
 
653 aa  688    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.22 
 
 
684 aa  773    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.59 
 
 
602 aa  650    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.05 
 
 
669 aa  770    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  56.1 
 
 
760 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.36 
 
 
682 aa  771    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.45 
 
 
801 aa  687    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.81 
 
 
615 aa  661    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.44 
 
 
672 aa  922    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  67.34 
 
 
753 aa  843    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 
685 aa  1391    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.39 
 
 
669 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.26 
 
 
753 aa  840    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.73 
 
 
672 aa  862    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.06 
 
 
662 aa  802    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.91 
 
 
684 aa  792    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  55.27 
 
 
783 aa  698    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  66.39 
 
 
651 aa  645    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  57.12 
 
 
627 aa  667    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  72.85 
 
 
656 aa  946    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.78 
 
 
687 aa  763    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  52.23 
 
 
697 aa  635    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.15 
 
 
704 aa  653    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61 
 
 
639 aa  664    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  55.42 
 
 
784 aa  700    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.38 
 
 
677 aa  711    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.11 
 
 
620 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.7 
 
 
793 aa  702    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  57.75 
 
 
689 aa  767    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.3 
 
 
611 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  70.22 
 
 
654 aa  895    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  73.78 
 
 
679 aa  916    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  64.51 
 
 
681 aa  808    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.67 
 
 
696 aa  728    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  55.27 
 
 
783 aa  698    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.32 
 
 
781 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.96 
 
 
743 aa  746    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.51 
 
 
698 aa  726    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.21 
 
 
657 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.76 
 
 
750 aa  634  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 
610 aa  629  1e-179  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.19 
 
 
643 aa  630  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.87 
 
 
783 aa  629  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.74 
 
 
610 aa  630  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.65 
 
 
608 aa  625  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.7 
 
 
608 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.01 
 
 
630 aa  628  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.29 
 
 
612 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.36 
 
 
604 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  52.67 
 
 
614 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
617 aa  620  1e-176  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0105  FtsH-2 peptidase  54.13 
 
 
645 aa  619  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0152057  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.96 
 
 
612 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  50.69 
 
 
769 aa  619  1e-176  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.84 
 
 
614 aa  619  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.04 
 
 
621 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.91 
 
 
607 aa  613  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  51.8 
 
 
608 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.98 
 
 
637 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.39 
 
 
617 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  52.14 
 
 
693 aa  609  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.83 
 
 
599 aa  611  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  59.84 
 
 
499 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.98 
 
 
619 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.15 
 
 
630 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.74 
 
 
639 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.47 
 
 
632 aa  599  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.37 
 
 
676 aa  599  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.61 
 
 
640 aa  599  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.72 
 
 
635 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  57.84 
 
 
637 aa  601  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  50.91 
 
 
673 aa  599  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.86 
 
 
647 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.98 
 
 
656 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  51.83 
 
 
665 aa  598  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.9 
 
 
633 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.48 
 
 
638 aa  597  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.51 
 
 
652 aa  595  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.73 
 
 
635 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  50.74 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0055  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.78 
 
 
671 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  50.24 
 
 
633 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  51.82 
 
 
640 aa  595  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  59.43 
 
 
616 aa  595  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.5 
 
 
636 aa  595  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.32 
 
 
640 aa  592  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.82 
 
 
638 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2664  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.23 
 
 
656 aa  593  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  50.08 
 
 
633 aa  592  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  50.08 
 
 
633 aa  592  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.6 
 
 
638 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  50.08 
 
 
633 aa  591  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>