More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4943 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 378 aa  734    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0519  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.77 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.759463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.9 
 
 		 375 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.960828  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1425  histidine kinase  51.63 
 
 		 392 aa  290  4e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.913373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4755  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.77 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7134  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.05 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6029  histidine kinase  49.31 
 
 		 367 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1411  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.92 
 
 		 385 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5789  histidine kinase  48.14 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0689027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4513  histidine kinase  50.68 
 
 		 382 aa  239  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0449708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1940  sensor histidine kinase  40.11 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1695  histidine kinase  42.08 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  43.75 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1628  histidine kinase  38.99 
 
 		 425 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.827591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.801726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2297  histidine kinase  37.47 
 
 		 467 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.465362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6772  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.01 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.616197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0081  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 		 400 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1033  histidine kinase  43.06 
 
 		 403 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0840  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.47 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3749  histidine kinase  39.49 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0957761  normal  0.0728761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0153  histidine kinase  38.79 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.810064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5938  histidine kinase  36.47 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25340  signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1497  ATPase domain-containing protein  40.4 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.463121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1459  histidine kinase  40.53 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6644  histidine kinase  34.74 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157131 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26830  signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863991  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4520  histidine kinase  40.07 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.348713  normal  0.333098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4783  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.714313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0471  histidine kinase  35.84 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 406 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 469 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5650  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 394 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.24 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 586 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  30.48 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  33.44 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 470 aa  126  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.35 
 
 		 469 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 459 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 		 435 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.55 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  32.33 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 487 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8630  histidine kinase  33.44 
 
 		 343 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0467071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30.72 
 
 		 469 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3007  histidine kinase  38.16 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 469 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  33.23 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 436 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  35.23 
 
 		 455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  26.74 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 515 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 466 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  34.09 
 
 		 463 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  31.1 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 524 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 461 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 455 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 455 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  30.18 
 
 		 471 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4875  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 461 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.699508  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4934  histidine kinase  34.93 
 
 		 515 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  31.08 
 
 		 412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 534 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1850  histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 455 aa  113  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 488 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2930  histidine kinase  28.85 
 
 		 468 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.327029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 		 438 aa  112  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  30.58 
 
 		 470 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4794  histidine kinase  29.8 
 
 		 454 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  30.64 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  32.58 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>