More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4858 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
382 aa  727    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.88 
 
 
401 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.11 
 
 
381 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 
405 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  37.31 
 
 
380 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
403 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4003  histidine kinase  47.32 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.758597  normal  0.4442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  37.74 
 
 
430 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  38.46 
 
 
380 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3749  histidine kinase  37.84 
 
 
393 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  44.12 
 
 
462 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  37.61 
 
 
442 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  35.78 
 
 
380 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
441 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
394 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  36.6 
 
 
393 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  43.97 
 
 
367 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  39.69 
 
 
372 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  45.15 
 
 
392 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
496 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  31.96 
 
 
400 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  35.99 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.26 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1747  Histidine kinase  37.06 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
394 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  39.08 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.01 
 
 
357 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  35.91 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 
439 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  32.28 
 
 
378 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  42.08 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2468  histidine kinase  35.98 
 
 
393 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000420477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2680  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.5 
 
 
271 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.913052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  37.15 
 
 
478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.94 
 
 
400 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7159  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  36.3 
 
 
414 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.65 
 
 
405 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2233  histidine kinase  40.93 
 
 
357 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  40.1 
 
 
395 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  38.92 
 
 
384 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  32.85 
 
 
430 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  34.57 
 
 
399 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
423 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
500 aa  123  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  35.56 
 
 
394 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  41.05 
 
 
397 aa  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  36.39 
 
 
410 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6093  histidine kinase  39.46 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0999956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1402  putative two-component system sensor kinase  40 
 
 
407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  42.65 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.45 
 
 
383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  34.59 
 
 
408 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  43 
 
 
375 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.64 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.109837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  36.67 
 
 
414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
612 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  39.04 
 
 
399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.63 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.33 
 
 
406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4945  histidine kinase  42.79 
 
 
351 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228101  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  42.19 
 
 
428 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  35.99 
 
 
408 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.2 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  41.03 
 
 
443 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4118  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.25 
 
 
376 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.23 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000329191  unclonable  0.0000000414728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  30.96 
 
 
438 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  36.09 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2086  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724108  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.86 
 
 
370 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.45 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  38.91 
 
 
470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  32.66 
 
 
446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3027  histidine kinase  40.17 
 
 
449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.256047  decreased coverage  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  35.27 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 
416 aa  113  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.33 
 
 
407 aa  113  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8792  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.4 
 
 
380 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.524564  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0540  histidine kinase  38.05 
 
 
453 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231728  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  37.05 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  39.37 
 
 
422 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  40.83 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  36.8 
 
 
402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  39.15 
 
 
447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4262  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
469 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
406 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  39.07 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5402  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.5 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  36.84 
 
 
291 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 
424 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
390 aa  110  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  33.8 
 
 
434 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
440 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
442 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>