More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4854 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4854  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
546 aa  1077    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3105  hypothetical protein  46.14 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3575  serine/threonine protein kinase  53.7 
 
 
498 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9373  hypothetical protein  51.9 
 
 
503 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4964  putative FHA domain containing protein  52.14 
 
 
532 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4684  serine/threonine protein kinase  40.17 
 
 
622 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.734593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3716  hypothetical protein  39.08 
 
 
596 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00638349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9039  serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 
594 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4576  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 
556 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0563383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  38.12 
 
 
535 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4500  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.29 
 
 
533 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0420485  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7325  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
730 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0416051  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5400  integral membrane protein MviN  32.47 
 
 
1217 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  28.57 
 
 
692 aa  94.4  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
691 aa  94  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4210  integral membrane protein MviN  34.76 
 
 
1652 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4534  serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 
679 aa  90.1  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3967  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 
468 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.21 
 
 
562 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  27.82 
 
 
625 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  27.82 
 
 
625 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0135  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
559 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00631753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  31.58 
 
 
519 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  27.94 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6434  serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.317855 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.43 
 
 
650 aa  83.6  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  27.2 
 
 
626 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  34.62 
 
 
618 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
575 aa  83.2  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.66 
 
 
668 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.85 
 
 
635 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2145  hypothetical protein  31.64 
 
 
473 aa  82.8  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0363  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
497 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  29.17 
 
 
403 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.43 
 
 
662 aa  80.5  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  31.68 
 
 
796 aa  80.5  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2669  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.43 
 
 
728 aa  80.5  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
502 aa  80.5  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26930  hypothetical protein  29.48 
 
 
754 aa  80.1  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0064  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.16 
 
 
707 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0054  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0845441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 
615 aa  77.4  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
663 aa  77.4  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4747  serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37930  hypothetical protein  33.33 
 
 
612 aa  77.4  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.59 
 
 
579 aa  77  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39640  hypothetical protein  31.6 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4419  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
563 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
666 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
612 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1254  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
522 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0774  serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 
595 aa  75.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 
651 aa  75.1  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
444 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1354  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
535 aa  74.7  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153882  normal  0.839237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  26.39 
 
 
763 aa  74.7  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
710 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5083  hypothetical protein  31.68 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3083  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
591 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.56 
 
 
602 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
596 aa  74.3  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 
703 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0026  serine/threonine protein kinase  32.89 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  32.89 
 
 
658 aa  73.6  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
612 aa  73.6  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0860  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 
502 aa  73.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131813 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  25.33 
 
 
638 aa  73.2  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  25.2 
 
 
625 aa  73.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
568 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  33.11 
 
 
824 aa  72.8  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0021  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
610 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 
582 aa  72.4  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
855 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.05 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  32.2 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12204  transmembrane serine/threonine-protein kinase L pknL  24.94 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  29.7 
 
 
419 aa  72  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3421  serine/threonine protein kinase  32.47 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000661816  hitchhiker  0.000104495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
790 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.79 
 
 
681 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.45 
 
 
551 aa  72  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  30.57 
 
 
501 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.05 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0683  serine/threonine protein kinase  29.65 
 
 
695 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.923157  normal  0.0435731 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  25.65 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 
700 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0052  serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.88 
 
 
653 aa  71.2  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.11 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>