More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4848 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  100 
 
 
241 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
237 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  38.96 
 
 
237 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 
260 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1028  methyltransferase type 11  42.42 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  42.42 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
634 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.9 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
710 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.43 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.5 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  39.66 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  38.84 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  32.79 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  39.23 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  32.79 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  32.79 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 
190 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  40.52 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.71 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
1012 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  27.84 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  32.74 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.4 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.54 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.78 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  35.1 
 
 
341 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
283 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.77 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  38.94 
 
 
711 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.4 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.11 
 
 
296 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  42.48 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  31.51 
 
 
168 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
332 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.19 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.88 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  35.67 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
328 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  38.79 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1157  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120807  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
328 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.07 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
328 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.59 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.9 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2962  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
401 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.93 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  34.96 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.33 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.88 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  40.18 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  33.04 
 
 
1914 aa  63.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.93 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  31.48 
 
 
400 aa  63.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.93 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.59 
 
 
234 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  35.03 
 
 
241 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  40.74 
 
 
202 aa  62.8  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
230 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.78 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.85 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.18 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  36.52 
 
 
313 aa  62.4  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  30.12 
 
 
204 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  37.07 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  41.53 
 
 
273 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
285 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.11 
 
 
345 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  44.07 
 
 
274 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
186 aa  62  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
261 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.82 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  25 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.64 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  30 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  33.03 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
415 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>