More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4844 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  100 
 
 		 96 aa  193  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  84.38 
 
 		 96 aa  170  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  81.25 
 
 		 96 aa  167  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  76.04 
 
 		 96 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  80.43 
 
 		 94 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  72.92 
 
 		 96 aa  154  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  75 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  73.96 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  75 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  79.35 
 
 		 93 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  73.96 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  73.96 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  72.63 
 
 		 97 aa  148  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  71.88 
 
 		 96 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  67.71 
 
 		 96 aa  146  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  71.88 
 
 		 96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  71.28 
 
 		 118 aa  144  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  69.47 
 
 		 95 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  70.53 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  65.96 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  66.67 
 
 		 98 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  70.33 
 
 		 111 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  69.47 
 
 		 96 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  67.71 
 
 		 95 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  64.89 
 
 		 101 aa  140  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  67.02 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  68.82 
 
 		 102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  62.11 
 
 		 96 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  69.89 
 
 		 98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  68.13 
 
 		 108 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  60.61 
 
 		 101 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  61.96 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  61.29 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  53.19 
 
 		 101 aa  120  8e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  54.35 
 
 		 96 aa  120  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  70.21 
 
 		 108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  51.65 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  47.31 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  45.74 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  45.74 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  45.65 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  44.57 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  43.48 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  44.32 
 
 		 94 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 97 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  40.22 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  38.71 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1916  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.136895  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  40.22 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  71.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5421  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0549173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4310  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3942  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.262713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  39.33 
 
 		 161 aa  70.5  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4417  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1512  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589185  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 94 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  39.13 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 95 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4637  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.329942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0569  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1228  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2777  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000778979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3216  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0455  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0189276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  32.61 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0461  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  35.42 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2569  30S ribosomal protein S6  36.78 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2193  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0141741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  31.52 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  35.63 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>