More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4819 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0051  DNA polymerase III subunits gamma and tau  85.42 
 
 
692 aa  662    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  62.24 
 
 
729 aa  674    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.698933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4819  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
732 aa  1423    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14657  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4926  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  57.47 
 
 
715 aa  643    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9315  DNA-directed DNA polymerase  75.58 
 
 
727 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9029  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  72.54 
 
 
863 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  54.27 
 
 
637 aa  558  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36570  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  53.36 
 
 
690 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.429514  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0649  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  66.92 
 
 
743 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0270  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.65 
 
 
812 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  70.47 
 
 
834 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  66.84 
 
 
690 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13753  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.39 
 
 
578 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.67 
 
 
808 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  65.63 
 
 
796 aa  524  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6564  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.28 
 
 
855 aa  525  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  50.65 
 
 
878 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0475  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  68.38 
 
 
765 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00148919  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.7 
 
 
737 aa  517  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0694  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.21 
 
 
1202 aa  515  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0548  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  67.21 
 
 
841 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0555  DNA polymerase III subunits gamma and tau  63.08 
 
 
1078 aa  515  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.533437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  66.93 
 
 
643 aa  515  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0427  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  61.19 
 
 
774 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0201  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  64.16 
 
 
713 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.51 
 
 
616 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  65.51 
 
 
616 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  64.52 
 
 
618 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  45.45 
 
 
1159 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.81 
 
 
926 aa  489  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  63.71 
 
 
872 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28470  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  62.64 
 
 
1122 aa  474  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0466  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  65.13 
 
 
712 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.957153  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  63.87 
 
 
872 aa  472  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0126  DNA polymerase III, subunit gamma and tau  55.44 
 
 
801 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1289  DNA polymerase III subunits gamma and tau  59.32 
 
 
960 aa  437  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  42.44 
 
 
579 aa  324  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.5 
 
 
582 aa  323  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.55 
 
 
579 aa  319  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  37.67 
 
 
582 aa  313  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000945747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.63 
 
 
589 aa  313  9e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.49 
 
 
551 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.94 
 
 
567 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.74 
 
 
562 aa  297  6e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.15 
 
 
562 aa  297  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.35 
 
 
562 aa  296  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.74 
 
 
562 aa  296  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.35 
 
 
562 aa  295  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.74 
 
 
562 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.75 
 
 
518 aa  295  2e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.74 
 
 
562 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.85 
 
 
562 aa  293  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.72 
 
 
900 aa  293  9e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.18 
 
 
562 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.18 
 
 
562 aa  292  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.33 
 
 
527 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000833689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.16 
 
 
735 aa  291  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.86 
 
 
569 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.53 
 
 
518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.02 
 
 
562 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.02 
 
 
550 aa  289  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.89 
 
 
755 aa  288  2e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.85 
 
 
649 aa  286  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.42 
 
 
561 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000159056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.44 
 
 
427 aa  281  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.95 
 
 
582 aa  281  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  41.54 
 
 
807 aa  280  6e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1175  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.78 
 
 
520 aa  280  7e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.19 
 
 
579 aa  280  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.69 
 
 
599 aa  279  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.91 
 
 
588 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000015496  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2586  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.13 
 
 
612 aa  277  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0700925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  38.82 
 
 
547 aa  277  6e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.37 
 
 
591 aa  276  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.34 
 
 
601 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.34 
 
 
601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.16 
 
 
632 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  41.71 
 
 
614 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.28 
 
 
559 aa  273  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  42.34 
 
 
648 aa  273  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  39.01 
 
 
652 aa  272  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  41.32 
 
 
572 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.27 
 
 
685 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.34 
 
 
606 aa  270  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.95 
 
 
554 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32 
 
 
550 aa  270  1e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.16 
 
 
642 aa  269  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.65 
 
 
610 aa  269  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0062  DNA polymerase III, tau subunit  42.57 
 
 
614 aa  267  4e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.55 
 
 
664 aa  268  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.93 
 
 
642 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.39 
 
 
690 aa  267  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.22 
 
 
644 aa  268  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.94 
 
 
688 aa  267  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  41.04 
 
 
606 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.93 
 
 
642 aa  267  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  40.05 
 
 
396 aa  267  5.999999999999999e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.54 
 
 
643 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0542  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.17 
 
 
570 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000531282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  39.6 
 
 
602 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>