111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4763 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
418 aa  827    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  54.82 
 
 
424 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  53.61 
 
 
427 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  52.84 
 
 
417 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  43.93 
 
 
437 aa  381  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  50.12 
 
 
429 aa  375  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  48.69 
 
 
449 aa  363  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  47.56 
 
 
413 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  41.57 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  51.34 
 
 
423 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  46.94 
 
 
418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  48.56 
 
 
421 aa  339  4e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  48.79 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  48.53 
 
 
421 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  43.88 
 
 
462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  40.97 
 
 
446 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  34.43 
 
 
437 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  33.25 
 
 
425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  33.94 
 
 
437 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  30.25 
 
 
434 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 
435 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  30.16 
 
 
469 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  32.59 
 
 
452 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  31.06 
 
 
473 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  30.86 
 
 
441 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  26.61 
 
 
429 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  25.78 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  26.23 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  25.89 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  30.34 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
437 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  26.46 
 
 
437 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  29.8 
 
 
470 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  26.01 
 
 
434 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  26.01 
 
 
437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  26.23 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  26.23 
 
 
437 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  29.68 
 
 
423 aa  140  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  26.79 
 
 
412 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  25.89 
 
 
438 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  27.23 
 
 
411 aa  139  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  29.04 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  30.41 
 
 
438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  24.72 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  29.6 
 
 
464 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  28.22 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  28.6 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  29.5 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  27.83 
 
 
464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  30 
 
 
442 aa  131  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  28.02 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  28.57 
 
 
460 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  28.77 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  29.46 
 
 
486 aa  126  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  30.2 
 
 
475 aa  126  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  30.02 
 
 
437 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  29.35 
 
 
440 aa  124  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  28.67 
 
 
439 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  28.19 
 
 
436 aa  123  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  27.86 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  26.86 
 
 
415 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  26.09 
 
 
415 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  26.13 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  25.97 
 
 
445 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.36 
 
 
409 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  26.32 
 
 
439 aa  97.4  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.58 
 
 
445 aa  92.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  24.9 
 
 
556 aa  91.3  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  26.57 
 
 
466 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  33.86 
 
 
574 aa  89.7  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24 
 
 
504 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  31.69 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  29.8 
 
 
572 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  30.17 
 
 
483 aa  77.4  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.13 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  33.72 
 
 
452 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
436 aa  63.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  31.78 
 
 
761 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709079 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 
376 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.13 
 
 
366 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  25.21 
 
 
478 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  24.37 
 
 
471 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.37 
 
 
468 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  24.37 
 
 
478 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  24.37 
 
 
478 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  24.37 
 
 
478 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  24.37 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  23.53 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  26.56 
 
 
425 aa  53.9  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.69 
 
 
490 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  27.48 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  23.08 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  26.63 
 
 
444 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  29.55 
 
 
455 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4119  FAD linked oxidase domain protein  22.33 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5275  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.93 
 
 
459 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27668  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  23.81 
 
 
475 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6967  oxidoreductase, FAD-dependent  26.61 
 
 
460 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.581883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7882  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.61 
 
 
436 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  25.31 
 
 
459 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>